逆転写酵素遺伝子を含むレトロンによる病原性発現調節とゲノム多様性との関係

逆转录酶基因逆转录子致病性表达的调控及其与基因组多样性的关系

• 批准号: 20018019
• 负责人: 島本 整
• 金额: $ 5.38万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20018019/
• 关键词: 逆転写酵素; レトロン; コレラ菌; Vibrio mimicus; 病原性; 可動性遺伝因子; マイクロアレイ

(1) 種々の病原細菌からのレトロンの単離・同定Vibrio cholerae non-O1, non-O139株であるN-11a株およびコレラ菌の類縁菌であるV.mimicus CS18株より新たなレトロンを単離し,解析を行った。V.cholerae N-11a株のレトロン-Vc154とV.mimicus CS30株のレトロン-Vm129由来のmsDNA-Vc154とmsDNA-Vm129は,いずれもDNA部分に複数のステム・ループ構造を持つ新たなタイプのmsDNAであった。これらのmsDNAは,病原性など細菌の生体調節機構に関与するアプタマーなどの機能を有していると推測された。(2) コレラ菌におけるレトロンとゲノム多様性との関係V. cholerae non-O1, non-O139株であるN-1b株は,O1, O139株が保有するレトロン-Vc95とは異なるレトロン-Vc81を保有していた。ゲノム上での挿入部位を調べたところ,レトロン-Vc81はレトロン-Vc95とまったく同じ部位に置換して挿入されていることが明らかになった。さらに,データベースにゲノム配列が登録されているV.cholerae V52株にも同じ領域に別のレトロン-Vc137が存在していることを発見した。以上の結果よりV.choleraeのレトロン挿入部位はゲノムの多様性をもたらしていると考えられた。(3) 薬剤耐性菌における薬剤耐性遺伝子を含む可動性遺伝因子の解析エジプトの家畜由来の細菌,魚の養殖場の環境由来菌,パレスチナの入院患者由来の臨床株,アフリカからの輸入動物由来株など数多くの薬剤耐性菌を解析し,新たな薬剤耐性遺伝子を含む種々の耐性遺伝子を検出し,解析した。それらの遺伝子の多くがインテグロンなどの可動性遺伝因子に含まれていた。

(1)Vibrio choleras non-O1, non-O139 strain N-11 strain C.mimicus CS18 strain C. nov. V. choleras N-11a strain-Vc154 and V.mimicus CS30 strain-Vm129 from msDNA-Vc154 and msDNA-Vm129, the DNA part of the complex number of the structure of the new type of msDNA. This is a hypothesis that pathogenic bacteria are involved in biological regulatory mechanisms. (2)The relationship between the diversity of the species and the relationship between the diversity of the species. Choleras non-O1, non-O139 strain N-1 b strain O1, O139 strain C-95 strain C-81 strain C-95 strain C-95 strain C-9 The position on the top of the box is adjusted to the position on the top of the box. In the meantime, the V. choleras V52 strain has been identified as a new species in the same field. The above results show that the V. choleras have different characteristics. (3)Analysis of resistant bacteria, resistant genes, resistant genes, including mobile gene factors; identification and analysis of bacteria of livestock origin, bacteria of fish farm origin, clinical strains of imported animal origin, strains of imported animal origin; identification and analysis of resistant bacteria, resistant genes, resistant genes, including resistant genes. The number of mobile transmission factors involved in the transmission of the virus is increasing.

项目成果

Association of a novel retron with a mobile genetic element integrated into the dihydrouridine synthase gene of Vibrio mimicus

新型逆转录子与整合到拟态弧菌二氢尿苷合酶基因中的可移动遗传元件的关联

• 发表时间: 2008
• 作者: 大澤春彦;他;Tadashi Shimamoto
• 通讯作者: Tadashi Shimamoto

Antibiotic resistance of the Japanese probiotic bacteria

日本益生菌的抗生素耐药性

• 发表时间: 2009
• 作者: Miyaki K;Lwin H;Masaki K;Song Y;Takahashi Y;Muramatsu M;Nakayama T;Ahmed M.Hammad
• 通讯作者: Ahmed M.Hammad

Isolation and molecular characterization of multidrug-resistant Gram-negative bacteria from imported flamingos in Japan

日本进口火烈鸟多重耐药革兰氏阴性菌的分离和分子鉴定

• 发表时间: 2009
• 期刊: Acta Veterinaria Scandinavica 51
• 作者: Kato N;Miki T;et.al.;Maiko Sato
• 通讯作者: Maiko Sato

レトロンによるコレラ菌の病原性発現制御機構の解析

逆转录子分析霍乱弧菌致病性表达调控机制

• 发表时间: 2009
• 作者: Tabara Y;Mild T;et.al.;Ahmed M. Hammad;島本整
• 通讯作者: 島本整

Characterization of integrons and antimicrobial resistance genes in clinical isolates of Gram-negative bacteria from Palestinian hospitals

• DOI: 10.1111/j.1348-0421.2009.00168.x
• 发表时间: 2009-11-01
• 期刊: MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
• 影响因子: 2.6
• 作者: Hussein, Amjad I. A.;Ahmed, Ashraf M.;Shimamoto, Tadashi
• 通讯作者: Shimamoto, Tadashi