Identification and characterization of small RNA specifically acting in Arabidopsis endosperm

特异作用于拟南芥胚乳的小RNA的鉴定和表征

• 批准号: 19770043
• 负责人: TATEMATSU Kiyoshi
• 金额: $ 2.06万
• 依托单位: National Institute for Basic Biology (2008)The Institute of Physical and Chemical Research (2007)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19770043/
• 关键词: 種子発芽; 小分子RNA; 胚乳特異的; 次世代シーケンス技術; AP2転写因子; miR172; AtABA2; エクスパンシン遺伝子; small RNA; 胚乳軟弱化; ABA生合成

シロイヌナズナ種子吸水時に胚乳で遺伝子発現制御に関与する小分子RNAの同定を行った。胚乳で特異的に発現する小分子RNAを次世代シーケンス技術により塩基配列決定を行った。その結果、胚乳特異的に発現するAP2転写因子群を認識する既知のmiR172や、アブシジン酸の生合成酵素AtABA2や細胞壁成分の加水分解に関わるエクスパンシン遺伝子をターゲットとする新奇小分子RNA候補が得られた。こうした遺伝子群が胚乳で機能することで種子発芽が制御されていると予想された。

The regulation of small RNA in endosperm during seed water absorption Endosperm-specific development of small RNA in the next generation of gene technology to determine gene alignment As a result, novel small RNA candidates were obtained from the known miR172, the endosperm-specific AP2 transcription factor group, and the enzyme AtABA2, which is involved in the hydrolysis of cell wall components. The endosperm function of the seed is controlled by the seed germination.

项目成果

Studies on early events in response to seed imbibition in Arabidopsis

拟南芥种子吸胀响应早期事件的研究

• 发表时间: 2007
• 作者: Preston;J.;Tatematsu;K.;Kamiya;Y.;and Nambara;E
• 通讯作者: E

Functional genomics on seed germination in Arabidopsis

拟南芥种子萌发的功能基因组学

• 发表时间: 2008
• 作者: Nambara;E.;Tatematsu;K.;and Kamiya;Y.
• 通讯作者: Y.

発芽生物学種子発芽の生理・生体・分子機構, 種生物学会編

萌发生物学：种子萌发的生理、生物学和分子机制，由种子生物学学会编辑

• 发表时间: 2009
• 作者: 南原英司;立松圭;内藤哲;南原ら
• 通讯作者: 南原ら

Phytochrome- and gibberellin-mediated regulation of abscisic acid metabolism during germination of photoblastic lettuce seeds

• DOI: 10.1104/pp.107.115162
• 发表时间: 2008-03-01
• 期刊: PLANT PHYSIOLOGY
• 影响因子: 7.4
• 作者: Sawada, Yoshiaki;Aoki, Miki;Toyomasu, Tomonobu
• 通讯作者: Toyomasu, Tomonobu

Small RNA expression profiling during seed germination in Arabidopsis thaliana

拟南芥种子萌发过程中的小RNA表达谱

• 发表时间: 2008
• 作者: Tatematsu;K.;Matsui;A.;Morosawa;T.;Kaminuma;E.;Okamoto;M.;Toyoda;T.;Shinozaki;K.;Kamiya;Y.;Seki;M.;and Nambara;E
• 通讯作者: E