权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

ＲＮＡ編集酵素ＡＤＡＲの基質認識機構の解明

阐明RNA编辑酶ADAR的底物识别机制

基本信息

批准号：
14J01433
负责人：
植村有里
金额：
$ 1.09万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-25 至 2016-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14J01433/
关键词：
遺伝子転写後修飾イノシン RNA編集

项目摘要

A-to-I RNA編集は、RNA配列の網羅的解析により編集部位が同定されるようになった。しかしながら、責任酵素であるADARsが、それぞれの生体内の編集部位をどのように認識し、区別しているのか未解明である。これは、ADAR1とADAR2はそれぞれ特定の配列に対する嗜好性があるものの、ある程度補完しあえる複雑性にも起因する。また、生化学的解析では編集活性を示さないADAR3については、生体内でのターゲット部位を含め、その存在意義は全く不明である。そこで本研究では、各ADARに結合するRNAと結合部位を1塩基レベルで同定し、ADARの基質認識機構の解明と、特にADAR3の生理的役割を明らかにすることを目的として、研究を開始した。まず、ADAR1,2,3 各酵素を安定的に発現する細胞株を作成した。これらに対してPAR-CLIP法を実施し、結合RNAを同定することに成功した。その後、これらの基質にRNA編集が生じていることを、確認した。また、ADAR1,2をノックダウンした細胞を用いてRNA-seqによる網羅的な編集部位の探索、編集効率の比較を行った。その結果、ADAR3は編集活性を持たず、更にADAR1,2の活性にも影響しないことが示唆された。以上のように計画通り研究が進展しており、現在ADAR3が不活性である理由を更に解析中である。

A-to-I RNA compilation, analysis of RNA arrangement, compilation parts, and analysis.しかしながら、Responsibility enzyme であるADARsが、それぞれの生内のassembled parts をどのようにknow し、Difference しているのかUnclear である.これは、ADAR1とADAR2はそれぞれSpecific arrangementに対する Hobby sex があるものの、ある Degree complement しあえるReplied 雑性にもCause する.また、Biochemical analysis and compilation activity をshow さないADAR3 については、In vivo でのターゲットparts をcontaining め、The meaning of その’s existence is all unknown である. In this study, each ADAR is bound to RNA and the binding site is the same, and the ADAR matrix is Understand the explanation of the organization, the purpose of the specific physiology of ADAR3, and the purpose of the research. The enzymes of ADAR1, 2, and ADAR1, 2, and 3 are stabilized by the current ADAR cell line. The PAR-CLIP method was successfully used, and the combined RNA method was successfully used. After その后, これらの matrix にRNA compiled が生じていることを, confirmed した. Exploration of editing sites and comparison of editing efficiency using the RNA-seq network of また, ADAR1,2 をノックダウンしたcells. As a result, the editing activity of ADAR3 has been maintained, and the activity of ADAR1 and 2 has been affected. The progress of the research and development of the above-mentioned project and the reasons for the inactivity of ADAR3 are currently being analyzed.