肝分化指向性ヒトiPS細胞による胆管がんモデル作製

利用肝分化导向的人iPS细胞创建胆管癌模型

• 批准号: 16K07135
• 负责人: 石川 哲也
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: National Cancer Center Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-01 至 2018-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16K07135/
• 关键词: がん組織由来; iPS細胞; 網羅的遺伝子発現; 次世代シークエンス; 遺伝子改変動物

胆管上皮細胞や肝細胞に分化させるiPS細胞をがん組織由来の初代培養細胞から作製した。作製したiPS細胞のマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析と次世代シークエンスとバイオインフォマティクス解析によるキノーム遺伝子及びがん関連遺伝子の変異を調べた。その結果、結腸がん組織または胃がん組織由来のiPS細胞は、線維芽細胞由来の標準的iPS細胞と比べ、各々特徴的な遺伝子発現プロファイルを示し、がん関連遺伝子の発現も上昇していた（Cancer Informatics, 15: 163-178, 2016)。一部の複数株は肝分化指向性のiPS細胞に特徴的な肝細胞遺伝子の発現上昇も同時に観察された。一方、結腸がん組織由来の初代培養細胞から作製したiPS細胞は、非がん組織には存在しないsingle nucleotide variants (SNVs)が検出された（World Journal of Stem Cells, in press)。胃がん組織由来の初代培養細胞から作製したiPS細胞にも、非がん組織には存在しないSNVsが検出された。これらの遺伝子変異の発がんやがん進展への関連性についてはまだ明らかではない。

The differentiation of bile duct epithelial cells and hepatocytes into iPS cells was studied. The gene expression analysis of iPS cells and the gene expression analysis of related genes The results showed that colon cancer tissue and iPS cells derived from gastric cancer tissue and standard iPS cells derived from vascular germ cells were significantly higher than those of normal iPS cells, and the development of associated genes was significantly higher (Cancer Informatics, 15: 163-178, 2016). A number of strains of iPS cells with liver differentiation orientation were observed to be characterized by an increase in the expression of hepatocyte genes. Single nucleotide variants (SNVs) are found in primary culture cells of one side and colon tissue origin (World Journal of Stem Cells, in press). The origin of gastric tissue and primary culture cells are not produced by iPS cells, but by SNVs in non-gastric tissue. The relationship between progress and development is different from that between progress and development.

项目成果

Analysis of gene expression in artificial cancer stem cell using spherical self-organization map

使用球形自组织图分析人工癌症干细胞中的基因表达

• 发表时间: 2016
• 作者: 妹尾彬正;笠井智成;Arun Vaidyanath;増田潤子;水谷昭文、石川哲也、妹尾昌治
• 通讯作者: 水谷昭文、石川哲也、妹尾昌治

Characterization of Gene Expression Patterns among Artificially Developed Cancer Stem Cells Using Spherical Self-Organizing Map.

使用球形自组织图的人为开发的癌症干细胞中基因表达模式的表征。

• DOI: 10.4137/cin.s39839
• 发表时间: 2016
• 期刊: Cancer informatics
• 影响因子: 2
• 作者: Seno A;Kasai T;Ikeda M;Vaidyanath A;Masuda J;Mizutani A;Murakami H;Ishikawa T;Seno M
• 通讯作者: Seno M

Next-generation sequencing traces human iPSC lines clonally generated from heterogeneous cancer tissue

下一代测序追踪从异质癌症组织克隆产生的人类 iPSC 系

• 发表时间: 2017
• 期刊: World Journal of Stem Cells
• 影响因子: 4.1
• 作者: Yoshiko Maida;Mami Yasukawa;Marco Ghilotti;Yoshinari Ando;Kenkichi Masutomi;Ishikawa T
• 通讯作者: Ishikawa T

特定3因子を用いてがん組織から作製されたヒトiPS細胞の次世代シークエンス解析

使用三个特定因素对癌症组织产生的人类 iPS 细胞进行下一代序列分析

• 发表时间: 2016
• 作者: Sotoyama H;Iwakura Y;Oda K;Sasaoka T;Takei N;Kakita A;Enomoto H;Nawa H;石川哲也
• 通讯作者: 石川哲也

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