ハイスループットRNAi法によるイネいもち病菌のゲノム機能解析
ハイスループットRNAi法によるイネいもち病菌のゲノム機能解析
批准号:
08F08426
负责人:
中屋敷 均
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2010
中文摘要
当研究室で構築されたハイスループットRNAiベクターpSilent-Duall (pSD1)を用いて、植物細胞壁分解酵素を対象としてサイレンシングによる機能解析を試みた。本研究では,40~50bpの配列を対象遺伝子から抽出し、それをつなげた合成遺伝子をサイレンシングトリガーとするBuilding Blocks法を用いた。対象とした遺伝子群は、細胞壁加水分解酵素であるxylanaseおよびcellobiohydrolase遺伝子ファミリーである。コムギいもち病菌のxylanaseサイレンシング株では病原性が低下していたが、細胞観察の結果、野生株に比べ貫穿糸形成が有意に抑制され、HR誘導の割合が増加していることが明らかとなった。また、垂直侵入後の水平的な感染拡大の速度も低下しており、xylanase遺伝子群が本菌の角皮侵入および病斑拡大の両方に機能していることが示唆された。一方、cellobiohydrolaseサイレンシング株においても病原性の低下がやや見られたが、貫穿糸形成率の低下より、パピラ形成誘導の割合が増加しており、これらの酵素群が本菌の異なった感染場面で機能している可能性が示唆された。
英文摘要
当研究室で構築されたハイスループットRNAiベクターpSilent-Duall (pSD1)を用いて、植物細胞壁分解酵素を対象としてサイレンシングによる機能解析を試みた。本研究では,40~50bpの配列を対象遺伝子から抽出し、それをつなげた合成遺伝子をサイレンシングトリガーとするBuilding Blocks法を用いた。対象とした遺伝子群は、細胞壁加水分解酵素であるxylanaseおよびcellobiohydrolase遺伝子ファミリーである。コムギいもち病菌のxylanaseサイレンシング株では病原性が低下していたが、細胞観察の結果、野生株に比べ貫穿糸形成が有意に抑制され、HR誘導の割合が増加していることが明らかとなった。また、垂直侵入後の水平的な感染拡大の速度も低下しており、xylanase遺伝子群が本菌の角皮侵入および病斑拡大の両方に機能していることが示唆された。一方、cellobiohydrolaseサイレンシング株においても病原性の低下がやや見られたが、貫穿糸形成率の低下より、パピラ形成誘導の割合が増加しており、これらの酵素群が本菌の異なった感染場面で機能している可能性が示唆された。
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会议论文
Dual promoter vectors for high-throughput gene function analysis by RNA silencing
通过 RNA 沉默进行高通量基因功能分析的双启动子载体
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Nguyen, et al.]
通讯作者:
et al.
いもち病菌ゲノムにおける水平移行遺伝子のエピジェネティクス制御による自己遺伝子化
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批准号:24K01758
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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批准号:22K19181
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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财政年份:2021
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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批准号:19658018
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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财政年份:2007
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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批准号:17026025
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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财政年份:2005
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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批准号:10660049
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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财政年份:1998
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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批准号:06760049
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:中屋敷 均
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依托单位:
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