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ハイスループットRNAi法によるイネいもち病菌のゲノム機能解析

利用高通量RNAi方法对稻瘟病菌进行基因组功能分析

基本信息

批准号：
08F08426
负责人：
中屋敷均
金额：
$ 1.47万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2010
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08F08426/
关键词：
RNAサイレンシング RNAi イネいもち病菌ポストゲノム病原性遺伝子

项目摘要

当研究室で構築されたハイスループットRNAiベクターpSilent-Duall (pSD1)を用いて、植物細胞壁分解酵素を対象としてサイレンシングによる機能解析を試みた。本研究では,40～50bpの配列を対象遺伝子から抽出し、それをつなげた合成遺伝子をサイレンシングトリガーとするBuilding Blocks法を用いた。対象とした遺伝子群は、細胞壁加水分解酵素であるxylanaseおよびcellobiohydrolase遺伝子ファミリーである。コムギいもち病菌のxylanaseサイレンシング株では病原性が低下していたが、細胞観察の結果、野生株に比べ貫穿糸形成が有意に抑制され、HR誘導の割合が増加していることが明らかとなった。また、垂直侵入後の水平的な感染拡大の速度も低下しており、xylanase遺伝子群が本菌の角皮侵入および病斑拡大の両方に機能していることが示唆された。一方、cellobiohydrolaseサイレンシング株においても病原性の低下がやや見られたが、貫穿糸形成率の低下より、パピラ形成誘導の割合が増加しており、これらの酵素群が本菌の異なった感染場面で機能している可能性が示唆された。

When the laboratory tests were performed on RNAi cells and pSilent-Duall (pSD1), cell wall-decomposing enzymes were analyzed in the same way as in the laboratory. In this study, 40~50bp was arranged as an example of extraction, synthesis and synthesis. The Building Blocks method was used. For example, the subgroup, the cell wall hydrolytic enzyme, the xylanase enzyme, the cellobiohydrolase subgroup, the cell wall hydrolytic enzyme, the cell wall hydrolytic enzyme and the cell wall. The pathogenicity of the pathogen was low, the pathogenicity was low, the results of cytopathic examination, the results of the wild plant, the intentional inhibition of the pathogen, the pathogenicity of the pathogen, the results of cell examination, the results of pathogenicity, the results of cell examination, the results of pathogenicity After vertical invasion, the horizontal infection rate is low, the infection speed is low, and the subgroup of xylanase is infected. The horny skin of this bacteria invades the disease spot, and the machine is capable of showing signs of infection. On the one hand, the pathogenicity of cellobiohydrolase is low, the formation rate of puncture system is low, the formation rate is low, the formation rate is low, and the enzyme group is sensitive to infection. The possibility of infection is not clear.