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メチオニン回収経路で機能する酵素群の網羅的なX線構造解析および機能に関する研究

对蛋氨酸回收途径中发挥作用的酶进行全面的 X 射线结构分析和功能研究

基本信息

批准号：
08J00327
负责人：
田村はるか
金额：
$ 0.58万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08J00327/
关键词：
CO_2固定エノラーゼ結晶構造解析構造生物学

项目摘要

本研究は、ほぼすべての生物に備わっている代謝経路のひとつであるメチオニン回収経路において機能する枯草菌(Bacillus subtilis)由来の酵素群についてのX線結晶構造解析、および種々のホモログタンパク質との構造比較に基づく、これらの詳細な構造-機能相関関係の解明を目指している。特にエノラーゼとして機能するMtnW (2,3-diketo-5-methylthiopentenyl-1-phosphate enolase)は、前年度にリガンドを含まないアポ型(非活性化状態)での構造解析に成功した。またMtnWは光合成CO_2固定化酵素RuBisCOの祖先タンパク質であることが知られており。両者の機能リンクを構造化学的な視点から解明するために、本年度は詳細な構造比較を行い、その結果をまとめ論文投稿を行った。さらに興味深いことに、このMtnW遺伝子が転写から翻訳に至る過程で、MtnWをコードするmRNAの一部分がメチオニン回収経路の上流部分で生成されるS-adenosylmethionineと直接結合することでMtnWのタンパク質の発現が抑制されていることがわかった。このような働きをするmRNAはRiboswitchと呼ばれ、最近、ゲノミクスおよびプロテオミクスに次ぐ第3のターゲットとして、盛んに研究が行われている。派遣先機関として選定した英国ケンブリッジ大学Alison Smith教授の研究室では、緑藻クラミドモナスのビタミンB1合成経路において、真核生物では初めてとなる2つのRiboswitchを発見し(PNAS,2007)、さらなる調節機構解明にむけた研究がおこなわれていた。そこで、クラミドモナスを材料として、今後のRiboswitchによるMtnWの転写発現調節機構解明に必要なRNAの抽出、精製、逆転写、PCRなどの実験操作を習得した。

In this study, bioinformatics and biochemistry were used in this study. In this study, biochemistry experiments were carried out. In this study, bioinformatics and biochemistry were used in this study. In this study, bioinformatics and bioinformatics were used in this study. In this study, bioinformatics, biodegradations, biodegradations, Special attention has been paid to the performance of the machine MtnW, which is the most important part of the system, and the previous year, the previous year has made a success in the analysis of the virus-containing virus (inactive state). Photosynthesis, MtnW, CO_2, immobilization, enzyme, RuBisCO, ancestor, ancestor, horse, leaf, etc. The researchers are able to analyze the information of the chemical industry, compare the industry this year, and submit articles on the basis of the results of the study. In this case, you need to know that you are going to have a bad situation, and that you are going to have a lot of trouble in the upper part of the mRNA. In the upper part of the mRNA, you need to generate the information S-adenosylmethionine in the upper part of the road. In this way, you will be able to suppress the impact of the accident. I don't know what to do. I don't know. Recently, I don't know. I don't know. Send the first opportunity to select the laboratory of Professor Alison Smith of the University of Heights in the UK, the laboratory of the algae plant, the synthesis of B1, the eukaryotes, the PNAS,2007, and the research institutes of the United Kingdom. In order to improve the quality of the material, and in the future, the Riboswitch system will write that the organization has explained that it is necessary to extract, refine, reverse write, and improve the operation of the RNA.