遺伝子情報の育種利用と畜産におけるバイオインフォマティクスの展開

分子生物学や遺伝学の発達により、経済的に重要な形質に関わる遺伝子の位置および効果に関する情報が明らかになってきている。このような遺伝子型情報を利用することは家畜の育種計画を決定する上で非常に有益である。1つめの研究では、家畜の育種および生産現場で、遺伝子型情報を利用したときの能力評価や経済効果を算出する方法についてこれまでの自身の研究や他の著者らの研究をまとめた。この成果は国内の雑誌に掲載された。家畜の経済的な形質は量的形質であることが多く、量的形質では、関連する遺伝子情報が完全ではなく、現状では遺伝子情報のみから遺伝的な能力の評価を行うのは困難である。それ問題を解決するために、近年、家畜の育種では、ゲノムワイドに存在する数万の一塩基多型からゲノム育種価を推定し、これを個体の遺伝的能力とするゲノミック評価が行われつつある。しかし、この評価法はゲノム育種価の正確度に大きく依存している。近年では、ゲノム育種価以外にも従来の表現型情報および血統情報を用いてゲノミック評価を行う必要性が議論されている。2つめの研究では、ゲノム育種価に加え、親の予測育種価、後代の表現型情報が利用できる場合を想定し、ゲノミック評価の有用性を検討した。本研究の研究成果は国内の学会で発表した。上記で述べたゲノミック評価の手法が適用できる場は、数万のSNPsのデータが利用できる場合に限られている。3つめの研究では、家畜の経済形質に関わる責任遺伝子がいくつか同定されつつある現状を想定して、それらの情報を用いて家畜の遺伝的能力を推定する簡便法を開発した。ここでは、シミュレーションデータに加え、マウスのデータを対象にすることにより、本方法の有用性を検討した。本研究の研究成果は国内の学会で発表し、現在、海外の論文に投稿中である。

分子生物学や遺伝学の発達により、経済的に重要な形質に関わる遺伝子の位置および効果に関する情報が明らかになってきている。このような遺伝子型情報を利用することは家畜の育種計画を決定する上で非常に有益である。1つめの研究では、家畜の育種および生産現場で、遺伝子型情報を利用したときの能力評価や経済効果を算出する方法についてこれまでの自身の研究や他の著者らの研究をまとめた。この成果は国内の雑誌に掲載された。家畜の経済的な形質は量的形質であることが多く、量的形質では、関連する遺伝子情報が完全ではなく、現状では遺伝子情報のみから遺伝的な能力の評価を行うのは困難である。それ問題を解決するために、近年、家畜の育種では、ゲノムワイドに存在する数万の一塩基多型からゲノム育種価を推定し、これを個体の遺伝的能力とするゲノミック評価が行われつつある。しかし、この評価法はゲノム育種価の正確度に大きく依存している。近年では、ゲノム育種価以外にも従来の表現型情報および血統情報を用いてゲノミック評価を行う必要性が議論されている。2つめの研究では、ゲノム育種価に加え、親の予測育種価、後代の表現型情報が利用できる場合を想定し、ゲノミック評価の有用性を検討した。本研究の研究成果は国内の学会で発表した。上記で述べたゲノミック評価の手法が適用できる場は、数万のSNPsのデータが利用できる場合に限られている。3つめの研究では、家畜の経済形質に関わる責任遺伝子がいくつか同定されつつある現状を想定して、それらの情報を用いて家畜の遺伝的能力を推定する簡便法を開発した。ここでは、シミュレーションデータに加え、マウスのデータを対象にすることにより、本方法の有用性を検討した。本研究の研究成果は国内の学会で発表し、現在、海外の論文に投稿中である。