DNAメチル化障害とその量的形質遺伝子座を用いた健康支援研究のモデル開発

利用 DNA 甲基化疾病及其数量性状位点进行健康支持研究的模型开发

• 批准号: 22K18403
• 负责人: 井原 一成
• 金额: $ 16.47万
• 依托单位: Hirosaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K18403/
• 关键词: DNAメチル化; エピジェネティックス; 環境影響; 量的形質遺伝子座; 健康支援; BDNF; エピジェネティック; 全ゲノム解析; 疫学; 環境

本研究では、約2,000人の地域住民において、BDNF遺伝子を例に、環境要因の影響を受けやすいことが見込まれるエクソンⅠのプロモーターの狭領域内で多数のCpG部位のメチル化率を測定し、全ゲノムシークエンス（WGS）データとスーパーコンピューターを用いることで、まず（A）メチル化率の量的形質遺伝子座（meQTL）を探索し、（B）BDNFのmRNA発現に影響を与えるCpG部位のメチル化障害を特定する。その上で（C）meQTLとメチル化率を考慮した上での、喫煙、運動習慣などの環境要因がBDNFのmRNAの発現に与える影響を検討することで、遺伝特徴とメチル化率を考慮した健康支援、precision healthの新しい研究モデルを開発することを目的としている。また（D）WGSデータとメチル化率とmRNA発現のデータを用いてDNA構造を考慮した転写メカニズムを明らかにするものである。本年は弘前市で行われた疫学調査に参加した737人について、mRNA用Paxgene採血管による血液の収集を試みた。血液検査参加者724名のうち684人より十分量の血液を採取できた。また、724人についてBDNF蛋白測定用の血清とメチル化率を測定するDNA抽出用の全血検体とを収集した。運動習慣や喫煙など環境要因は、アンケート票で情報取集した。前年度以前に収集した血液検体の収集状況も調査し、2021年度は、健診参加者536人中530人よりmRNA用Paxgene採血管による採取で525人から十分な採血量を得、また同数の血清を保管していたことを確認した。メチル化率測定のDNA抽出用に、同数の生化学検査後の血液を収集していた。血液分析と既存のWGSデータを用いた統計解析に向けて、研究分担者の森信と１回、谷澤と2回、いずれも弘前大学に来訪してもらい打ち合わせを行った。

In this study, we explored QTL for the quantitative transformation rate of most CpG sites in A narrow region of about 2,000 inhabitants, including BDNF gene and environmental factors.(B) BDNF mRNA expression is affected by CpG sites and specific chemical barriers. QTL and protein conversion rates are considered for the purpose of investigating the effects of environmental factors on BDNF mRNA expression, such as smoking, exercise habits, and other factors, on health support, precision health, and new research opportunities. (D) WGS gene expression rate and mRNA expression rate are considered in DNA structure. This year, 737 people participated in the epidemic investigation in Hiromae City, and Paxgene blood collection tubes for mRNA were tested. Blood test participants 724 724 human serum samples for BDNF protein assay and whole blood samples for DNA extraction Exercise habits, smoking, environmental factors, information collection In 2021, 530 out of 536 participants in health care were investigated for the collection status of blood samples collected in the previous year, and 525 out of 536 participants were tested for mRNA in Paxgene blood collection tubes. DNA extraction for the determination of the rate of DNA and collection of blood after biochemical examination of the same number Blood analysis and existing WGS data are used in statistical analysis, and research participants are sent to Hirosaki University.