Whole genome screening of plant membrane transporter for inorganic elements

植物膜无机元素转运蛋白的全基因组筛选

• 批准号: 20200031
• 负责人: NAKANISHI Yoichi
• 金额: $ 20.13万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20200031/
• 关键词: 膜輸送と輸送タンパク質; 機能ゲノミクス; 微量元素; 膜輸送

Plant cells contain all elements of the universe. Transporters that import/export inorganic elements have been poorly identified yet. In Arabidopsis genome, about 1,400 transporter-related genes were fond in silico, of which function is almost unknown. To overcome whole genome screening from possible candidates, we constructed an expression library consisted of the transporter gene(s). We cloned 1,380 genes (98% of candidates). Expression screening by use of the library has been shown to be powerful tool for identification of novel transporters. We screened five candidate genes that posed tolerance of heavy metal elements (Mn, Ni, Zn, Cd) to host organisms. We also developed research tools that can analyze level(s) of element(s) in living organisms.

植物细胞包含了宇宙的所有元素。输入/输出无机元素的转运体尚未得到很好的识别。在拟南芥基因组中，约有1,400个转运蛋白相关基因被计算机模拟发现，其中的功能几乎是未知的。为了克服从可能的候选者中进行全基因组筛选，我们构建了由转运蛋白基因组成的表达文库。我们克隆了1,380个基因（98%的候选基因）。通过使用文库进行表达筛选已被证明是鉴定新型转运蛋白的有力工具。本研究筛选出了5个与宿主生物对重金属元素（Mn、Ni、Zn、Cd）的耐受性相关的候选基因。我们还开发了可以分析生物体中元素水平的研究工具。

项目成果

シロイヌナズナの金属耐性に関わる新規の膜タンパク質

拟南芥金属耐受性中涉及的新型膜蛋白

• 发表时间: 2012
• 作者: 中西洋一;佐古建志;佐藤世理;前島正義
• 通讯作者: 前島正義

2色発光モリブデンセンサー蛋白質による酵母細胞内のモリブデン濃度測定

使用双色发光钼传感器蛋白测量酵母细胞中的钼浓度

• 发表时间: 2011
• 作者: 前田道子;中西洋一
• 通讯作者: 中西洋一

Quantification, organ-specific accumulation and intracellular localization of type II H(+)-pyrophosphatase in Arabidopsis thaliana.

• DOI: 10.1093/pcp/pcq096
• 发表时间: 2010-08
• 期刊: Plant & cell physiology
• 影响因子: 4.9
• 作者: Shoji Segami;Y. Nakanishi;Masa H. Sato;M. Maeshima

アントシアニンの発色に関わる膜輸送体遺伝子群の探索

寻找参与花青素颜色形成的膜转运蛋白基因

• 发表时间: 2009
• 作者: 中西洋一;佐古建志;幡谷恵莉子;今井悠;前島正義
• 通讯作者: 前島正義

動物細胞で発現する植物膜輸送体遺伝子ライブラリとその総当たりスクリーニング

动物细胞表达的植物膜转运蛋白基因库及其强力筛选

• 发表时间: 2010
• 作者: 中西洋一;佐藤世理
• 通讯作者: 佐藤世理