课题基金 / 基金详情

機能ゲノミクスと遺伝学的に手法による線虫の化学走性学習の分子機構の解明

機能ゲノミクスと遺伝学的に手法による線虫の化学走性学習の分子機構の解明
利用功能基因组学和遗传学方法阐明线虫趋化学习的分子机制
批准号:
17017011
负责人:
飯野 雄一
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 --

项目摘要

项目成果

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線虫C.エレガンスの化学走性行動は特定の化学物質に近寄る、あるいはそれから遠ざかる行動である。さまざまな化学物質に対して、それを受容する感覚神経がそれぞれ同定されており、化学走性行動には可塑性も観察されるため、神経機能の理解のよいモデルとなる。本研究では、神経細胞種に特異的な遺伝子発現をゲノムワイドに解析することにより、化学走性やその可塑性の機構の理解に役立てることを目的とした。線虫の特定の組織・細胞からmRNAを選択的に精製する方法として、mRNA tagging法を開発した。この方法は、mRNAのポリAに結合する性質のあるポリA結合蛋白質(PABP)にタグ配列をつけたものを細胞特異的プロモーターで特定の細胞群に発現させ、タグに対する抗体を用いて免疫沈降することにより、その細胞群に含まれるmRNAを特異的に回収する方法である。この方法を約50細胞からなる感覚神経群に適用し、単離したmRNAを用いてマイクロアレイ解析を行うことにより、感覚神経に発現する遺伝子群の同定に成功した。さらに、この方法を異なるイオンを受容する左右のASE感覚神経(それぞれ一個の神経細胞)に適用し、左右で非対称に発現する遺伝子の体系的な同定を試みた。mRNA tagging法でmRNAを単離後、RT-PCRで左右非対称に発現することのわかっている遺伝子のmRNAの回収量を調べた。その結果、ASER株由来mRNA:ASEL株由来mRNAでの量比に関して、右のASERで発現するgcy-5では5.4倍、左のASELで発現するgcy-6で10倍、gcy-7で91倍の濃縮が確認された。単離したmRNAをプローブに用いて、全ゲノムオリゴアレイにハイブリダイゼーションを行い、左右非対称に発現する多くの候補遺伝子を同定し、そのうち若干数については確かに左右非対称に発現することを確認した。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
MVR-1, a Novel Helix-Turn-Helix Transcripion Factor, Is Required for Pruning Excessive Neurites in Caenorhabditis elegans
MVR-1 是一种新型螺旋转螺旋转录因子,是修剪秀丽隐杆线虫过多神经突所必需的
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Curr.Biol. 15(17)
影响因子: --
作者: [fujimori, t., Higuchi, M., Sato, H., Aiba, H., Muramatsu, M., Hihara, Y., Sonoike, K., H.Kunitomo, E.Kage]
通讯作者: E.Kage
Identification o ciliated sensory neuron-expressed genes in Caenorhabditis elegans using targeted pull-down of poly(A) tails
使用 Poly(A) 尾的靶向下拉鉴定秀丽隐杆线虫中纤毛感觉神经元表达的基因
DOI: --
发表时间: 2005
期刊: Genome Biol. 6(2)
影响因子: --
作者: [fujimori, t., Higuchi, M., Sato, H., Aiba, H., Muramatsu, M., Hihara, Y., Sonoike, K., H.Kunitomo]
通讯作者: H.Kunitomo
Artificial evolution of brain structure by a whole brain-whole body model
  • 批准号:
    23K18149
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    飯野 雄一
  • 依托单位:
Comprehensive understanding of avoidance behavior caused by environmental sensing
  • 批准号:
    22H00416
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $27.12万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    飯野 雄一
  • 依托单位:
Reinforcement learning on Caenorhabditis elegans
  • 批准号:
    20K21805
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 资助金额:
    $4.16万
  • 财政年份:
    2020
  • 负责人:
    飯野 雄一
  • 依托单位:
Study of Molecular and Neural Circuit Mechanisms for Behavioral Switching
  • 批准号:
    17H00890
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $26.96万
  • 财政年份:
    2017
  • 负责人:
    飯野 雄一
  • 依托单位:
海外基金