Dynamic Proteomics of Transcriptional and Nuclear Architecture

转录和核结构的动态蛋白质组学

• 批准号: 20221010
• 负责人: HAMAKUBO Takao
• 金额: $ 126.13万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20221010/
• 关键词: プロテオミクス; 複合体解析; スプライシング; 転写調節; 細胞周期; 核スペックル; 核小体; クロマチン修飾; 核微細構造; ヒストン修飾; 生体イメージング; 軟Ｘ線顕微鏡; 核内受容体; 軟X線顕微鏡; 核タンパク質; RNAプロセッシング; モノクローナル抗体

In this study, we developed a highly sensitive quantitative proteomics analysis technique by using magnetic beads with immobilized specific antibodies. By generating highly specific monoclonal antibodies against HNF4-alpha, LXR-alpha, or WTAP, we have identified protein complexes for the transcriptional control of glucose metabolism related genes or RNA-processing machinery for the cell cycle control through distribution to nuclear speckles or nucleoli.

在这项研究中，我们开发了一种高灵敏的定量蛋白质组学分析技术，使用固定化特异性抗体的磁珠。通过产生针对HNF4-α、LXR-α或WTAP的高度特异的单抗，我们已经确定了用于糖代谢相关基因转录调控的蛋白质复合体，或者通过分布到核斑点或核仁来控制细胞周期的RNA加工机制。

项目成果

三量体Gタンパク質活性化とRGS相互作用のFRETによる生細胞イメージング

通过 FRET 对三聚体 G 蛋白激活和 RGS 相互作用进行活细胞成像

• 发表时间: 2010
• 作者: 寺田晃士;他2名;増田一之
• 通讯作者: 増田一之

PTX3 in neutrophils and macrophages: localization and mechanisms of secretion

中性粒细胞和巨噬细胞中的 PTX3：定位和分泌机制

• 发表时间: 2012
• 作者: Asada;K.;Tomiwa;K.;Okada;M.;Itakura;S.;菅原康弘;中村知裕;塩見春彦;Takamaga H;Razvina Olga
• 通讯作者: Razvina Olga

CDGAPはROBO1と相互作用して血管内皮細胞のSLIT2依存的な遊走に関与する

CDGAP 与 ROBO1 相互作用并参与血管内皮细胞的 SLIT2 依赖性迁移

• 发表时间: 2010
• 作者: 根本悟士;川村猛;岩成宏子;太期健二;堀内恵子;南敬;児玉龍彦;浜窪隆雄
• 通讯作者: 浜窪隆雄

Epigenetically coordinated GATA2 binding is necessary for endothelium specific endomucin sxpression

表观遗传协调的 GATA2 结合对于内皮特异性内粘蛋白表达是必需的

• 发表时间: 2011
• 期刊: The EMBO Journal in press
• 作者: Kanki Y;Kohro T;Jiang S;Tsutsumi S;Mimura I;Suehiro J;Wada Y;Ohta Y;Ihara S;Iwanari H;Naito M;Hamakubo T;Aburatani H;Kodama T;Minami T.
• 通讯作者: Minami T.

Development of the compact low-energy soft x-ray CT instrument for the soft material structural analysis 」

开发用于软材料结构分析的紧凑型低能软X射线CT仪器

• 发表时间: 2008
• 作者: M.Miyoshi,T.Hamakubo,T.Kodama ,A.Ko ishikawa,M.Tsuchiya;N
• 通讯作者: N