Development of DNA methylation measurement device using nano-carbon film electrode
利用纳米碳膜电极开发DNA甲基化测量装置
基本信息
- 批准号:20350042
- 负责人:
- 金额:$ 12.56万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
We developed direct electrochemical detection of DNA methylation using nanocarbon film formed by electron cyclotron resonance(ECR) sputtering. The developed method is based on oxidation potential difference between cytosine and methylated cytosine without any labeling. By optimizing electrode surface using electro- chemical pretreatment, we used this film to quantitatively detect single cytosine methylation regardless of the methylation position in the sequence including retino- blastoma gene fragment (24 mer). The nanocarbon film electrode also allowed us to realize the detection of DNA methylation ratios by measuring methylated 5'-cytosine- phosphoguanosine (CpG) repetition oligonucleotides (60 mer) with different methylation ratio. To improve the sensitivity for detecting the bases in the CpG oligonucleotides, we successfully used an exonuclease P1 to digest the target CpG oligonucleotide to an identical mononucleotide 5'-NMP. To develop the DNA methylation detection device, the microdisk array electrode which further improves sensitivity was fabricated using nanocarbon film which suppress biomolecules adsorption.
我们发展了利用电子回旋共振(ECR)溅射形成的纳米碳膜直接检测DNA甲基化的方法。所开发的方法是基于胞嘧啶和甲基化胞嘧啶之间的氧化电位差异,而不需要任何标记。通过电化学预处理优化电极表面,我们利用该膜定量检测了包括视网膜母细胞瘤基因片段(24mer)的序列中的单胞嘧啶甲基化,而不考虑甲基化位置。纳米碳膜电极还可以通过测量不同甲基化比率的甲基化5‘-胞嘧啶-磷酸鸟苷(CpG)重复寡核苷酸(60mer)来实现DNA甲基化比率的检测。为了提高检测CpG寡核苷酸中碱基的灵敏度,我们成功地使用外切酶P1将目标CpG寡核苷酸消化为相同的单核苷酸5‘-NMP。为了研制DNA甲基化检测装置,利用纳米碳膜抑制生物分子的吸附,制备了进一步提高检测灵敏度的微盘阵列电极。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Electrochemical determination of urinary damaged DNA molecules by using sputtered nanocarbon film electrode (Plenary talk)
使用溅射纳米碳膜电极电化学测定尿液受损DNA分子(全体报告)
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:丹羽修;加藤大;小森谷真百合;後藤圭祐;廣野滋
- 通讯作者:廣野滋
生体分子センシングを目的としたナノカーボン薄膜電極の開発
用于生物分子传感的纳米碳薄膜电极的开发
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Naoki Yoshida;Masato Noguchi;Tomonari Tanaka;Takeshi Matsumoto;Naoya Aida;Masaki Ishihara;Atsushi Kobayashi;Shin-ichiro Shoda;丹羽修
- 通讯作者:丹羽修
Development of a Sputtered Nanocarbon Film Based Microdisk Array Electrode for the Highly Stable Detection of Serotonin
- DOI:10.1002/elan.201000636
- 发表时间:2011-04
- 期刊:
- 影响因子:3
- 作者:Hiroaki Inokuchi;Dai Kato;A. Ueda;O. Niwa
- 通讯作者:Hiroaki Inokuchi;Dai Kato;A. Ueda;O. Niwa
スパッタナノカーボン膜を用いた電気化学分析・バイオセンシング
使用溅射纳米碳薄膜进行电化学分析和生物传感
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:丹羽修;加藤大;関岡直行;廣野滋
- 通讯作者:廣野滋
新規スパッタカーボン薄膜電極を用いた酵素との直接電子移動に関する検討
使用新型溅射碳薄膜电极研究酶直接电子转移
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:井ノ口裕朗;上田晃生;廣野滋;う加藤大;丹羽修
- 通讯作者:丹羽修
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