Circadian adaptation dynamics of cyanobacterial genome

蓝藻基因组的昼夜适应动态

• 批准号: 20370072
• 负责人: IWASAKI Hideo
• 金额: $ 13.23万
• 依托单位: Waseda University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20370072/
• 关键词: シアノバクテリア; 概日リズム; 明暗応答; 環境適応; Synechococcus; 環境応答; シグマ因子; kai遺伝子; マイクロアレイ

Based on microarray analysis combined with molecular genetics, we revealed that more than one third of genes on the genome exhibit significant circadian transcription rhythms with peaking at either subjective dawn or dusk under continuous light conditions. When cells were transferred to the dark, most of gene expression was dramatically suppressed and gave rise to serious discrepancy between transcriptomic and proteomic profiles. Moreover, we found less than 8% of genes on the genome were induced even in the dark, and most of them were under the control of the Kai proteins. Since the kai gene mRNAs were rapidly lost in the dark, our observation revealed the first example of clock-controlled transcription without de novo clock gene expression.

基于微阵列分析结合分子遗传学，研究人员发现，在连续光照条件下，超过三分之一的基因组基因表现出显著的昼夜节律转录，在主观黎明或黄昏达到峰值。当细胞转移到黑暗中时，大多数基因表达被显著抑制，并导致转录组和蛋白质组谱之间的严重差异。此外，我们发现即使在黑暗中，基因组上也只有不到8%的基因被诱导，其中大部分是在Kai蛋白的控制下。由于kai基因mrna在黑暗中迅速丢失，我们的观察揭示了第一个时钟控制转录而没有新生时钟基因表达的例子。

项目成果

環境適応に関わる周期的時空間パターンダイナミクス : シアノバクテリアを用いて

与环境适应相关的周期性时空模式动态：利用蓝细菌

• 发表时间: 2008
• 作者: A.Seki;M.Hanaoka;Y.Akimoto;S.Masuda;H.Iwasaki;K.Tanaka;岩崎秀雄
• 通讯作者: 岩崎秀雄

多細胞性シアノバクテリア Anabaena sp.PCC 7120における概日リズム

多细胞蓝藻鱼腥藻 PCC 7120 的昼夜节律

• 发表时间: 2009
• 作者: 櫛笥博子;久下沼正之;松岡正城;岩崎秀雄
• 通讯作者: 岩崎秀雄

Cyanobacterial cell lineage analysis of the spatiotemporal hetR expression profile during heterocyst pattern formation in Anabaena sp. PCC 7120.

• DOI: 10.1371/journal.pone.0007371
• 发表时间: 2009-10-12
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Asai H;Iwamori S;Kawai K;Ehira S;Ishihara J;Aihara K;Shoji S;Iwasaki H
• 通讯作者: Iwasaki H

Bacterial Circadian Programs (Eds. J. Ditty, S. Mackey, C.H. Johnson)(Factors involved in transcriptional output from the Kai-protein-based circadian oscillator)

细菌昼夜节律程序（Eds. J. Ditty、S. Mackey、C.H. Johnson）（参与基于 Kai 蛋白的昼夜节律振荡器转录输出的因子）

• 发表时间: 2009
• 作者: 野村照明;堂元沙織;高木豪;石井俊輔;Iwasaki H
• 通讯作者: Iwasaki H

生命リズムのメタファーとイメジャリー

生活节奏的隐喻和意象

• 发表时间: 2009
• 作者: 長沼孝雄;中川真一;五島直樹;佐々木保典;廣瀬哲郎;岩崎秀雄
• 通讯作者: 岩崎秀雄