和牛集団における分子メンテナンスシステムの開発と育種改良

和牛分子维持系统开发及育种改良

• 批准号: 20580309
• 负责人: 向井 文雄
• 金额: $ 2.08万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20580309/
• 关键词: 分子メンテナンスシステム; 一塩基多型; SNPs; 黒毛和種; AFLP; 個体識別; 親子鑑別

和牛、特に黒毛和種は世界で最も高品質の牛肉を生産する我が国の固有種である。一方、この集団は近交の高まりや多様性の減少など、集団構造の問題を抱えている。これら集団の維持管理と改良推進を同時に成し遂げるためには、DNAマーカーを利用した新たな維持改良システムの構築が有効であると考えられる。そこで、本研究は和牛集団に対しSNPsを中心としたDNAマーカーシステムを開発することを目的とした(分子メンテナンスシステム)。本分子メンテナンスシステムの基礎となるSNPsマーカーとして、遺伝子頻度が0.5程度を示すSNPsマーカーをAFLP法の利用により探索した。黒毛和種20頭を用いたAFLP法を行い、バンドを持つ個体が10から18頭である多型バンドを回収後、シーケンスにより変異の同定を行った。データベースを基にプライマーを作成し、PCR-RFLP法により黒毛和種100頭の遺伝子型判定を行った。推定された各マーカーの遺伝子型頻度、遺伝子頻度をもとに個体識別確率、父権否定確率を算出した。256組の選択的プライマーを用いてAFLP法を行ったところ、合計115本の候補バンドが検出された。それらに対し変異の同定およびマーカーの作成を行ったところ、40個のマーカーが開発できた。黒毛和種100頭を用いて遺伝子型判定を行ったところ、各マーカーにおけるマイナーアリルの頻度は0.18から0,48であり、全マーカーを用いた場合の個体識別確率、父権否定確率はそれぞれ8.29937×10^<-23>、0.99915となった。

Wagyu, special に black-haired wagyu breed に The world 's で highest quality <s:1> beef を production する our が country' s <s:1> native breed である. One party, the <s:1> <s:1> group. The close acquaintance of <s:1> is high, ま や polymorphism is reduced, な な, and the group structure has problems を and えて る る る. こ れ ら set 団 の と improved propulsion を に into at the same time maintain management し hence げ る た め に は, DNA マ ー カ ー を using し た new た な maintaining improved シ ス テ ム の build が have sharper で あ る と exam え ら れ る. そ こ で, this study は and cattle 団 に し seaborne SNPs を center と し た DNA マ ー カ ー シ ス テ ム を open 発 す る こ と を purpose と し た (molecular メ ン テ ナ ン ス シ ス テ ム). This molecular メ ン テ ナ ン ス シ ス テ ム の based と な る SNPs マ ー カ ー と し て 0.5 degree, but 伝 frequency が を shown す SNPs マ ー カ ー を markers の using に よ り explore し た. Black hair and kinds of 20 head を い た markers method を い, バ ン ド を hold つ individual が 10 か ら 18 head で あ る polymorphism バ ン ド を 収 back after, シ ー ケ ン ス に よ り - different の set を row っ た. デ ー タ ベ ー ス を base に プ ラ イ マ ー を made し, PCR - RFLP method に よ り traces of black wool and 100 head of の 伝 sub-type line judge を っ た. Presumption さ れ た each マ ー カ ー の heritage 伝 sub-type frequency, but 伝 frequency を も と に 権 deny individual identification of probabilistic, father of probabilistic を calculate し た. The 256 groups of の sentaku プ ラ イ マ ー を with い て line markers method を っ た と こ ろ, total 115 の alternate バ ン ド が 検 out さ れ た. そ れ ら に し seaborne - different の with fixed お よ び マ ー カ ー の made line を っ た と こ ろ, 40 の マ ー カ ー が open 発 で き た. Black hair and a 100 を with い て heritage 伝 sub-type line judge を っ た と こ ろ, various マ ー カ ー に お け る マ イ ナ ー ア リ ル の frequency は 0.18 か ら 0 で 13 あ り, whole マ ー カ ー を with い た occasions の 権 deny individual identification of probabilistic, father of probabilistic は そ れ ぞ れ 8.29937 * 10 ^ < - > 23, 0.99915 と な っ た.

项目成果

The ubiquitin 1igase gene (WWP1)is responsible for the chicken muscular dystrophy

泛素 1igase 基因 (WWP1) 是导致鸡肌营养不良症的原因

• 发表时间: 2008
• 期刊: FEBS letters 582
• 作者: Matsumoto;H.
• 通讯作者: H.

Development of SNPs markers for individual identification and parentage test in Japanese Black cattle population

日本黑牛群体个体识别和亲子鉴定的 SNP 标记的开发

• 发表时间: 2008
• 作者: Hara;K.
• 通讯作者: K.