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一塩基多型特異的RNAスプライシングの探索と応用

一塩基多型特異的RNAスプライシングの探索と応用
单核苷酸多态性特异性RNA剪接的探索与应用
批准号：
17KT0128
负责人：
佐藤 哲也
金额：
$2.91万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2017
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2017-07-18 至 2019-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17KT0128/
关键词：
個別化医療SNPsRNAスプライシングバイオインフォマティクストランスクリプトーム

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项目成果

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疾病発症や病態進行の原因を解明するため、様々な遺伝要因や環境要因の探索が行われてきた。中でも遺伝要因である一塩基多型（SNP）の解析は大規模に行われ、疾患に関連するSNPsが数多く同定された。しかし、疾患関連SNPsの中で、疾患原因遺伝子のコーディング領域に存在するものは全体のわずか10%しかなく、その多くは原因遺伝子との関連がわかっていない。そこで、本研究では、RNAスプライシングを通して、翻訳産物に対して劇的な変化をもたらす重大な遺伝子多型を同定する。具体的には、1000人ゲノム計画等ヒト臨床サンプルの遺伝子発現（RNA-seq）データを利用して、ヒトで実際に起こっているSNPsと関連したRNAスプライシングの解明を目指す。最終年度では、これまでに同定されたSNPsとエクソン情報から、SNPsに影響を受けるRNAスプライシングを検出し、さらにスプライシングエクソン翻訳領域の機能を予測するプログラムを作成した。RNAスプライシングに関与するSNPsを検出して、その翻訳産物の機能を推定するためのプログラムツールは未だ開発されていなかった。そこで本研究で実施したデータ解析アルゴリズムを実装する新規プログラムの作成を行い、その開発に成功した。今後は、がん患者のSNPsと関連するスプライシングエクソンがどのような疾病と関連しているかを明らかにし、病態の進行を予測するためのモデルを構築する必要がある。本研究の結果、個人差で見られるRNAスプライシングパターンと病態進行の程度との間の関係が明らかになれば、複雑な病態の詳細な理解へとつながることが期待される。
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会议论文
差分プライバシーの検証の基盤となる形式化の構築
  • 批准号：
    24K14893
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $2.91万
  • 财政年份：
    2024
  • 负责人：
    佐藤 哲也
  • 依托单位：
    Tokyo Institute of Technology
Low-temperature formation of PTFE thin films by electronic excitation of fluorocarbon condensed layers and its application as a surface treatment method.
  • 批准号：
    23K04394
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $2.83万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    佐藤 哲也
  • 依托单位：
    University of Yamanashi
固体中の磁気回転効果を用いたスピン力学回転変換機構の理論的研究
  • 批准号：
    23KJ0702
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $0.96万
  • 财政年份：
    2023
  • 负责人：
    佐藤 哲也
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Ion Beam Chemistry in the Heaviest Region of the Periodic Table
  • 批准号：
    22K18276
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
  • 资助金额：
    $16.22万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    佐藤 哲也
  • 依托单位：
    Japan Atomic Energy Agency
国内基金
海外基金
基于特异性SNPs标记技术测定湘西黄牛杂交优势研究
  • 批准号：
    2025JJ70498
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    郭青春
  • 依托单位：
    怀化职业技术学院
以3D人脑类器官为模型研究精神分裂症风险SNPs的作用机制
  • 批准号：
    2023JJ40789
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    谌婷
  • 依托单位：
    中南大学
珲春黑蜂保种效果精准评价及抗寒SNPs挖掘
  • 批准号：
    32302813
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    30.00万元
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    徐凯
  • 依托单位：
    吉林省养蜂科学研究所
SNPs提升CO2地质封存泥岩盖层封堵能力的作用机制研究
  • 批准号：
    42272176
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    57万元
  • 批准年份：
    2022
  • 负责人：
    李颖
  • 依托单位：
    西南石油大学