Genome wide localization analysis of BphT1 binding region on Rhodococcus jostii RHA1.

红球菌 jostii RHA1 上 BphT1 结合区的全基因组定位分析。

• 批准号: 20880031
• 负责人: HARA Hirofumi
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Okayama University of Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20880031/
• 关键词: 放線菌; 環境汚染物質; ChIP-chip解析; 二成分制御系; 転写制御因子; 環境汚染物質分解; ロドコッカス属細菌; DNAマイクロアレイ; 網羅的解析

Rhodococcus jostii RHA1 was grown on a broad range of aromatic compounds and vigorously degrades polychlorinated biphenyls (PCBs). Two-component signal transduction system, BphT1T2, is necessary for activation of biphenyl degradation genes in R. jostii RHA1. In this study, we performed global chromatin immunopercipitation-on-chip (ChIP-chip) analysis to identify novel BphT1 binding region in R. jostii RHA1. As a result, we identified 9 ORFs as direct target of BphS1T1, which including IclR type transcriptional regulator, possible endonuclease, and some hypothetical proteins. This result indicated that BphS1T1 is a master regulator of biphenyl degradation, and directly activated to transcriptional regulator and endonibonuclease to regulate expression level of many ORFs in RHA1.

Jostii红球菌RHA1生长在广泛的芳香族化合物上，并能有效降解多氯联苯（PCBs）。双组分信号转导系统BphT1T2是R. jostii RHA1.在这项研究中，我们进行了全球染色质免疫沉淀芯片（ChIP芯片）分析，以确定新的BphT1结合区域在R。jostii RHA1.结果发现9个ORF是BphS1T1的直接靶基因，包括IclR型转录调控因子、可能的内切酶和一些假设的蛋白质。这一结果表明BphS1T1是联苯降解的主调节因子，并直接激活转录调节因子和核糖核酸内切酶来调节RHA1中许多ORF的表达水平。

项目成果

放線菌 Streptomyces griseus のグローバル転写因子AdpAのChIP-seq解析

灰色链霉菌全局转录因子 AdpA 的 ChIP-seq 分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 肥後明佳;原啓文;大西康夫;堀之内末治
• 通讯作者: 堀之内末治

Involvement of a novel ABC transporter and monoalkyl phthalate ester hydrolase in phthalate ester catabolism by Rhodococcus jostii RHA1. Appl.

一种新型 ABC 转运蛋白和单烷基邻苯二甲酸酯水解酶参与红球菌 jostii RHA1 的邻苯二甲酸酯分解代谢。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Environ. Microbiol. 76
• 作者: H. Hara;G.R. Stewart,;W.W. Mohn
• 通讯作者: W.W. Mohn

Involvement of a Novel ABC Transporter and Monoalkyl Phthalate Ester Hydrolase in Phthalate Ester Catabolism by Rhodococcus jostii RHA1

• DOI: 10.1128/aem.02621-09
• 发表时间: 2010-03-01
• 期刊: APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 4.4
• 作者: Hara, Hirofumi;Stewart, Gordon R.;Mohn, William W.
• 通讯作者: Mohn, William W.

放線菌Streptomyces griseusのグローバル転写因子AdpAのChIP-seq解析

灰色链霉菌全局转录因子 AdpA 的 ChIP-seq 分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 肥後明佳;原啓文;大西康夫;堀之内末治
• 通讯作者: 堀之内末治