Computational infrastructure for high-throughput genome bioinformatics

高通量基因组生物信息学的计算基础设施

• 批准号: LE0347727
• 负责人: Prof Mark Ragan
• 金额: $ 27.3万
• 依托单位: The University of Queensland
• 依托单位国家: 澳大利亚
• 项目类别: Linkage Infrastructure, Equipment and Facilities
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 澳大利亚
• 起止时间: 2002-01-01 至 2003-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://dataportal.arc.gov.au/RGS/Web/Grants/LE0347727
• 关键词: Computational; infrastructure; throughput; genome; bioinformatics

We propose a high-performance computing and web facility for genome bioinformatics. It will provide a common software development environment in support of molecular biosciences, systems biology and complex systems modelling at the Institute for Molecular Bioscience at University of Queensland, and at Queensland University of Technology. The platform will support Australia's first genome-scale bioinformatics research website, with unique software and mirrors of the IBM Biological Pattern Discovery, UC San Diego MEME/MetaMEME/MAST, and NGI comparative genomics websites. Australian/NZ researchers will access the facility at no cost for high-throughput use of unique software, website mirrors and other important tools for genome bioinformatics.

我们提出了一个高性能的计算和网络设施的基因组生物信息学。它将提供一个共同的软件开发环境，支持昆士兰州大学分子生物科学研究所和昆士兰州科技大学的分子生物科学、系统生物学和复杂系统建模。该平台将支持澳大利亚第一个基因组规模的生物信息学研究网站，拥有独特的软件和IBM生物模式发现，加州大学圣地亚哥分校MEME/MetaMEME/MAST和NGI比较基因组学网站的镜像。 澳大利亚/新西兰的研究人员将免费访问该设施，以高通量使用独特的软件、网站镜像和其他重要的基因组生物信息学工具。