Activities of functional RNA molecules containing unnatural bases in cultured cells

培养细胞中含有非天然碱基的功能性RNA分子的活性

• 批准号: 20710176
• 负责人: KIMOTO Michiko
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20710176/
• 关键词: 生体分子; 核酸; バイオテクノロジー; 人工塩基対; 転写; RNA干渉; 培養細胞; 培養

By using in vitro transcription with our unnatural base pair systems, we prepared shRNA molecules containing a series of unnatural bases at a specific position and evaluated their RNAi activities in cultured cells. We found that the activity was retained by replacement with unnatural bases in some specific positions within the passenger and guide strands of the shRNA molecules, and that the tolerance by unnatural-base replacements depended on the size of the unnatural base.

通过使用我们的非天然碱基对系统的体外转录，我们制备了在特定位置含有一系列非天然碱基的shRNA分子，并在培养细胞中评估了它们的RNAi活性。我们发现，通过在shRNA分子的乘客链和引导链内的某些特定位置替换非天然碱基，活性得以保留，并且非天然碱基替换的耐受性取决于非天然碱基的大小。

项目成果

PCRと転写で機能する人工塩基対による機能性コンポーネントのRNA中への位置選択的取り込み

使用在 PCR 和转录中起作用的人工碱基对将功能成分选择性地掺入 RNA 中

• 发表时间: 2009
• 作者: OSAWA;Mari;松田純;木本路子
• 通讯作者: 木本路子

An unnatural base pair system for efficient PCR amplification and functionalization of DNA molecules.

• DOI: 10.1093/nar/gkn956
• 发表时间: 2009-02
• 期刊: Nucleic acids research
• 影响因子: 14.9
• 作者: Kimoto M;Kawai R;Mitsui T;Yokoyama S;Hirao I
• 通讯作者: Hirao I

A Unique Fluorescent Base Analogue for the Expansion of the Genetic Alphabet

• DOI: 10.1021/ja100806c
• 发表时间: 2010-04-14
• 期刊: JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
• 影响因子: 15
• 作者: Kimoto, Michiko;Mitsui, Tsuneo;Hirao, Ichiro
• 通讯作者: Hirao, Ichiro

Site-specific fluorescent labeling of RNA fragments by transcription using an unnatural base pair system

使用非天然碱基对系统通过转录对 RNA 片段进行位点特异性荧光标记

• 发表时间: 2008
• 作者: T.Sakanakura;K.Mizuno;S.Kobayashi;湯沢豊・工藤一嘉;松田純;M.Kimoto
• 通讯作者: M.Kimoto

新規蛍光人工塩基対

新型荧光人工碱基对

• 发表时间: 2009