Development of a translation system using expanded genetic alphabets through unnatural base pairs

通过非自然碱基对使用扩展遗传字母表开发翻译系统

• 批准号: 24710256
• 负责人: KIMOTO Michiko
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24710256/
• 关键词: 人工塩基対; 翻訳; 転写; 複製; tRNA; mRNA; T7 RNA ポリメラーゼ; 無細胞タンパク質合成系; ｔRNA; T7 RNAポリメラーゼ

For the expansion of the genetic alphabet of DNA, we studied several codon-anticodon interactions in a cell-free translation system involving hydrophobic unnatural bases. For this project, we mainly worked on to establish efficient transcription systems and their template DNA preparation methods which allow incorporation of hydrophobic unnatural bases at desired potions into DNA and RNA. The results found from this project would open up further development on a translation system involving unnatural base pairs orthogonal to natural base pairs.

为了扩展DNA的遗传字母表，我们研究了含有疏水性非自然碱基的无细胞翻译系统中的几种密码子-反密码子相互作用。在这个项目中，我们主要致力于建立高效的转录系统及其模板DNA制备方法，以允许将所需药水中的疏水性非天然碱基掺入DNA和RNA中。本项目的研究结果将为非自然碱基对与自然碱基对垂直的翻译系统的进一步发展奠定基础。

项目成果

平尾一郎 研究室

平尾一郎实验室

The third base pair'Ds-Px'in PCR amplification

PCR扩增中第三个碱基对Ds-Px

• 发表时间: 2012
• 作者: Rie Yamashige;Michiko Kimoto;Yusuke Takezawa;Akira Sato;Tsuneo Mitsui;Shigeyuki Yokoyama;Ichiro Hirao
• 通讯作者: Ichiro Hirao

人工塩基対システムおよびクリック反応による機能性RNAの部位特異的修飾

使用人工碱基配对系统和点击反应对功能性 RNA 进行位点特异性修饰

• 发表时间: 2012
• 作者: 石塚匠;木本路子;佐藤旭;平尾一郎
• 通讯作者: 平尾一郎

Thermal stability of hydrophobic unnatural base pairs in duplexes

双链体中疏水性非天然碱基对的热稳定性

• 发表时间: 2014
• 作者: Michiko Kimoto;Ichiro;Hirao
• 通讯作者: Hirao

Site-specific labeling of RNA by a replication-transcription system using a genetic alphabet expansion with two unnatural base pairs

通过复制-转录系统使用两个非自然碱基对的遗传字母表扩展对 RNA 进行位点特异性标记

• 发表时间: 2013
• 作者: Michiko Kimoto;Rie Yamashige;Ichiro Hirao
• 通讯作者: Ichiro Hirao