Study of bacterial adaptation and evolution for low temperature environments in Antarctica

南极低温环境细菌适应与进化研究

• 批准号: 21510207
• 负责人: BABA Tomoya
• 金额: $ 3万
• 依托单位: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 (2011)Transdisciplinary Research Integration Center (2009-2010)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21510207/
• 关键词: 細菌; ゲノム; 環境適応; 低温; 南極; 環境微生物; ゲノム解析; 新規微生物; 機能解析; 共生

The genome studies of the Antarctic bacteria living at low temperature environments are very limited and to be developed further more. I have tried to understand on the genome-level for the mechanisms concerning with low temperature environment adaptation of an Antarctic bacterium. I isolated a psychrophilic bacterium Pseudomonas sp. MP1 from a"Moss Pillar", which Japanese Antarctic Research Expedition had discovered in East Antarctica, and sequenced the complete genome of it. The comparative genome analysis of MP1 with related Pseudomonas sp. isolated in other continents revealed that genes of MP1 has adapted lower temperature environments on entire genome-level in its evolution. This study will be the first report for the bacterial entire genome-level adaptation to lower temperature environments in Antarctica.

对生活在低温环境下的南极细菌的基因组研究非常有限，有待进一步发展。我试图从基因组水平上了解南极细菌适应低温环境的机制。我分离出一种嗜冷细菌假单胞菌属。 MP1来自日本南极考察队在南极洲东部发现的“苔藓柱”，并对其完整基因组进行了测序。 MP1 与相关假单胞菌属的比较基因组分析。在其他大陆分离的结果表明，MP1的基因在其进化过程中在整个基因组水平上适应了较低的温度环境。这项研究将是第一份关于细菌全基因组水平适应南极洲较低温度环境的报告。

项目成果

南極大陸Pseudomonas属細菌のゲノム特性

南极假单胞菌的基因组特征

• 发表时间: 2012
• 作者: 馬場知哉;阿部貴志;豊田敦;藤山秋佐夫;伊村智;神田啓史;本山秀明;仁木宏典
• 通讯作者: 仁木宏典

Cold Tolerance Genes of an Antarctic Bacterium, Pseudomonas antarctica

南极细菌（南极假单胞菌）的耐冷基因

• 发表时间: 2009
• 作者: Kato K;Yoshida R;Kikuzaki A;Hirai T;Kuroda H;Hiwasa-Tanase K;Takane K;Ezura H;Mizoguchi T;T.Maeshiro;Yasuhide Okuyama;馬場知哉
• 通讯作者: 馬場知哉