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Calculation of Characteristics of Constraints for DNA Sequences and its Applications to Code Construction

Calculation of Characteristics of Constraints for DNA Sequences and its Applications to Code Construction
DNA序列约束特征的计算及其在代码构建中的应用
批准号：
21560394
负责人：
KAMABE Hiroshi
金额：
$1.83万
依托单位：
Gifu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2009 至 2011
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21560394/
关键词：
情報理論通信路容量計算論的言語理論DNAコンピュータDNA計算符号理論入力制約のある通信路記号力学系制約符号入力制約コンマフリー符号whiplashモデル文脈自由文法

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In this research we have investigated the calculation of the capacity of constraints for DNA computation and coding scheme for the constraints. We have obtained two kinds of results. One of them is how to calculate the capacity of constraint described as context free grammar. The second is how to calculate the capacity of constraints for parsing DNA programs uqiquely. From the last result we have obtained a guideline for constructing codes for the constraints.
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会议论文
Outfix-free and intercode con-straints for DNA squences
DNA 序列的无外缀和互码约束
DOI： --
发表时间： 2011
期刊： Proceeding of 2011 IEEE International Symposium on Information Theory
影响因子： --
作者： [高博昭, 上原秀幸, 大平孝, Hiroshi Fujisaki, H. Kamabe]
通讯作者： H. Kamabe
Outfix-free and intercode constraints for DNA sequences
DNA 序列的无外缀和互码约束
DOI： 10.1109/isit.2011.6033809
发表时间： 2011
期刊： Proceeding of 2011, IEEE International Symposium on Information Theory
影响因子： --
作者： [高博昭, 上原秀幸, 大平孝, Hiroshi Fujisaki, H. Kamabe, Azlan ABD AZIZ and Yasunori lWANAMI, Hiroshi Kamabe]
通讯作者： Hiroshi Kamabe
Constraints for DNA Sequences by Formal Language and its Capacity
形式语言及其容量对 DNA 序列的约束
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： Proceedings of the World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing 2010
影响因子： --
作者： [Nanao, S., Masuyama, H., Kasahara, S., and Takahashi, Y., Hiroshi Kamabe]
通讯作者： Hiroshi Kamabe
Constraints for DNA sequences by formal languages and its capacity
正式语言及其容量对 DNA 序列的限制
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： Proceeding of Nature and Biologically Inspired Computing 2010
影响因子： --
作者： [Cong Li, Yasunori lwanami, H. Kamabe]
通讯作者： H. Kamabe
共 6 条
    Theory of run-length constraint codes and combinatorial recording codes for novel high density recording
    • 批准号：
      19K11822
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $1.66万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      KAMABE Hiroshi
    • 依托单位：
      Gifu University
    Asymptotic Analysis of DNA Computation using Information Theoretic Method
    • 批准号：
      19560374
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $1.25万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      KAMABE Hiroshi
    • 依托单位：
      Gifu University
    海外基金