Characterization of a grape variety'Koshu' through comparative genomic hybridization and transcriptomic analysis

通过比较基因组杂交和转录组分析表征葡萄品种“Koshu”

• 批准号: 21580050
• 负责人: GOTO Nami
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: National Research Institute of Brewing
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21580050/
• 关键词: ブドウ; Vitis vinifera; 甲州; ゲノム; CGH解析; DNAマイクロアレイ; 網羅的発現解析; ジーンチップ; ゲノムDNA

Genomic structure of 'Koshu' was more closely related with oriental Vitis vinifera cultivars than with occidental cultivars and largely different from that of a wild grape species. Even though the genome of 'Koshu' contained a limited number of characteristically different sequences, these differences probably do not influence the character of 'Koshu'. Transcriptomic analysis revealed that the expression of some disease resistance and stress response related genes in the berry skin of 'Koshu' during ripening was higher than in 'Chardonnay'.

与西方葡萄品种相比，“高州”葡萄基因组结构与东方葡萄属葡萄品种的亲缘关系更近，与野生葡萄品种的亲缘关系也有较大差异。尽管“Koshu”的基因组包含有限数量的特征不同的序列，但这些差异可能不会影响“Koshu”的特征。转录组学分析表明，果州果实成熟过程中果皮中某些抗病和胁迫反应相关基因的表达量高于霞多丽。

项目成果

ブドウ'甲州'及び'Chardonnay'果皮(2009,2010)の遺伝子発現の比較

‘甲州’和‘霞多丽’葡萄皮基因表达比较（2009、2010）

• 发表时间: 2012
• 作者: 後藤(山本)奈美;沼田美子代;後藤(山本)奈美
• 通讯作者: 後藤(山本)奈美

ブドウ甲州とシャルドネ果皮の遺伝子発現の比較

甲州葡萄皮和霞多丽葡萄皮基因表达比较

• 发表时间: 2010
• 作者: 後藤(山本)奈美;沼田美子代;後藤(山本)奈美;上岡大嗣・沼田美子代・後藤(山本)奈美
• 通讯作者: 上岡大嗣・沼田美子代・後藤(山本)奈美

ブドウ'甲州'及び'Chardonnay'果皮(2009, 2010)の遺伝子発現の比較

‘甲州’和‘霞多丽’葡萄皮的基因表达比较（2009、2010）

• 发表时间: 2012
• 作者: 後藤(山本)奈美;沼田美子代
• 通讯作者: 沼田美子代

ブドウ甲州の遺伝子配列の特徴

甲州葡萄基因序列特征

• 发表时间: 2009
• 作者: 後藤(山本)奈美;沼田美子代;後藤(山本)奈美;上岡大嗣・沼田美子代・後藤(山本)奈美;上岡大嗣・沼田美子代・後藤(山本)奈美
• 通讯作者: 上岡大嗣・沼田美子代・後藤(山本)奈美