デング由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発
デング由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発
批准号:
09F09096
负责人:
黒田 裕
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011
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現在のところワクチンもないデング熱は、東南アジアの広い地域で公衆衛生上の問題となっている。デングウイルスは、DEN1~4の4種類の型に大別され、それらのエピトープ領域とウイルス型に対する抗体の特異性を解明する事は重要な研究課題である。本計画では、抗体認識の特異性に直接関わる可能性が高いデングウイルスのエンベロープ糖タンパク質(以下、Eタンパク質)の第3ドメイン(以下、E3D;96残基)に注目し、その変異体解析を行い、抗体認識機構(及び部位)を分子レベルで解明する。平成23年度では、デングウイルス3型及び4型由来のE3Dを、pET発現系を用いて大腸菌で発現し、通常の精製法(ニッケルレジン、HPLC)で、高純度に精製した(培地1L当たり30mgの収量)。高純度に精製した3型E3D及び4型E3DのX線結晶構造をそれぞれ、1.8Åと2.2Åの分解能で決定し、座標をPDBに仮登録した。さらに、3型E3D、4型E3Dに対するポリクロナル抗体を作製した。また、3型E3D及び4型E3Dの抗体認識部位の数残基を互いに入れ替えた変異体(Epitope Grafted Mutant; EGM)を8種類構築し、大量発現し、精製した。現在、EGM変異体とE3Dを型特異的に識別する抗体の相互作用をElisa法で解析中である。これらの相互作用解析の結果を上記の高分解能X線結晶構造と比較することで、抗体のウイルス型特異性の物理化学的な解明が期待される。
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難結晶化タンパク質変異体に対するヘテロシーディング法
难结晶蛋白突变体的异种播种方法
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[小林慶, Mohammad M Islam, 野口恵一, 養王田正文, 黒田裕]
通讯作者:
黒田裕
短いペプチドの新しい溶解度測定法の開発
开发一种新的短肽溶解度测量方法
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[島田広海, モハマド モニル イスラム, モンスル アラム カーン, 辻良太郎, 黒田裕]
通讯作者:
黒田裕
超単純化BPTIに於ける揺らぎ~X線結晶構造解析を用いた分子レベルでの解明~(Molecular Fluctuations in Extensively Simplified BPTI Variants Examined by X-ray Crystallography)
通过 X 射线晶体学检查广泛简化的 BPTI 变体中的分子波动
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[黒田裕, イスラム M モハマド]
通讯作者:
イスラム M モハマド
X-Ray Crystal Structures of Extensively Simplified BPTI Variants Determined Using the KEK Photon Factory Facility
使用 KEK 光子工厂设施确定的广泛简化的 BPTI 变体的 X 射线晶体结构
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mohammad M Islam, Shihori Sohya, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda]
通讯作者:
Yutaka Kuroda
点変異によって13度熱安定化したBPTI変異体の構造及び熱安定性の解析
点突变热稳定13度的BPTI突变体的结构和热稳定性分析
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[モハマド M イスラム, 惣谷志保里, 野口恵一, 城所俊一, 養王田正文, 黒田裕]
通讯作者:
黒田裕
共 19 条
ペプチドタグを用いたタンパク質のアモルファス凝集体の制御及びその細胞毒性の解析
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批准号:17F17392
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2017
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负责人:黒田 裕
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依托单位:
神経ペプチドの体系的なデータベースの構築と機械学習法を用いたその構造傾向性の予測
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批准号:15F15080
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:黒田 裕
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依托单位:
アミノ酸配列単純化法を用いた蛋白質のフォールディング・溶解度を定量的に調べる研究
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批准号:16041247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.1万
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财政年份:2004
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负责人:黒田 裕
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依托单位:
海外基金