ペプチドタグを用いたタンパク質のアモルファス凝集体の制御及びその細胞毒性の解析
ペプチドタグを用いたタンパク質のアモルファス凝集体の制御及びその細胞毒性の解析
批准号:
17F17392
负责人:
黒田 裕
金额:
$1.41万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-11-10 至 2020-03-31
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タンパク質の不定形な凝集(アモルファス凝集)は、創薬やバイオ産業において重要な現象であるにもかかわらず、その物理化学的特徴解析及び生物学的影響は殆ど解明されていない。本計画では、受入研究者が独自に開発した3~7残基から成る溶解性制御タグ(Solubility Controlling Peptide;SCPタグ)を用いてタンパク質(デング4型由来エンベロープ糖タンパク質第3ドメイン、以下DEN4-ED3)を不定形な可溶性凝集体(soluble amorphous aggregates)に会合させた。くわえて、SCPタグ配列を変異させることで凝集体のサイズを制御し、不定形で可溶な凝集体を安定的に形成させ、凝集の物性や構造を動的光散乱法などの分光学的手法を用いて明らかにした。また、単量体では無毒なDEN4-ED3にSCPタグを付加し可溶性会合体を形成させると細胞毒性を有することを解明した。さらに、可溶性会合体が大きな凝集体に成長すると細胞毒性が失われるということも見出した。神経変性疾患の原因分子とされているアミロイドでも類似した観測がされており、アミロイド線維核(pre-fibril)は毒性を有し、線維に成長したアミロイドは細胞毒性を失うという報告が多くなされている。しかし、アモルファス凝集では我々が知る限り初めての報告である。以上のことから、タンパク質が比較的小さなアモルファスな会合体を形成すると細胞毒性が生ずることを解明した。なお、現在執筆中の論文においては、外国人特別研究員Velmurugan氏が執筆した原稿を基に論文を共同で仕上げて投稿する予定であったが、コロナウイルス流行のため、執筆が遅れている。
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DOI:
10.3390/biom9060250
发表时间:
2019-06-01
期刊:
BIOMOLECULES
影响因子:
5.5
作者:
[Saotome, Tomonori, Yamazaki, Toshio, Kuroda, Yutaka]
通讯作者:
Kuroda, Yutaka
溶解性制御タグ(SCPタグ)を用いたタンパク質凝集体の形成速度の解析及びその制御法の開発
使用溶解度控制标签(SCP标签)分析蛋白质聚集体的形成率并开发控制方法
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Onchaiya Sawaros, Velmurugan Punitha, 黒田 裕]
通讯作者:
黒田 裕
Biophysical characterization of an insoluble species formed by a chemically intact single disulfide bonded BPTI
由化学完整的单一二硫键 BPTI 形成的不溶性物质的生物物理表征
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Punitha Velmurugan, Yutaka Kuroda]
通讯作者:
Yutaka Kuroda
Amorphous aggregates of dengue variants induce irreversible depolarization of mitochondria and the release of cytochrome c. online
登革热变异体的无定形聚集体诱导线粒体不可逆去极化和细胞色素 c 的释放。
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Aklima Jannatul, Velmurugan Punitha, Kuroda Yutaka, Ohta Yoshihiro]
通讯作者:
Ohta Yoshihiro
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Velmurugan Punitha, Aklima Jannatul, Ohta Yoshihiro, Kuroda Yutaka]
通讯作者:
Kuroda Yutaka
神経ペプチドの体系的なデータベースの構築と機械学習法を用いたその構造傾向性の予測
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批准号:15F15080
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:黒田 裕
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依托单位:
デング由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発
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批准号:09F09096
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2009
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负责人:黒田 裕
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依托单位:
アミノ酸配列単純化法を用いた蛋白質のフォールディング・溶解度を定量的に調べる研究
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批准号:16041247
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.1万
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财政年份:2004
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负责人:黒田 裕
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依托单位:
海外基金