相対論的ab initio分子動力学手法の開発と重原子分子反応への適用
相対論的ab initio分子動力学手法の開発と重原子分子反応への適用
批准号:
09J01103
负责人:
大谷 優介
金额:
$0.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2010
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英文摘要
本年度は分子シミュレーション手法のひとつであるAb initio分子動力学(AIMD)法とMakri-Millerの半古典法を組み合わせ、トンネル効果を見積もる汎用的な手法の開発を行った。AIMD法はab initio電子状態計算から得られるエネルギー勾配をもとに原子核のニュートンの運動方程式を解くことによって分子シミュレーションを行う方法である。ポテンシャル関数を必要とせず、任意の化学反応へ適用可能な汎用的な手法であるが、原子核を古典的に扱っているという欠点がある。原子核は電子に比べ数千倍のオーダーで重く、量子効果はそれほど大きくないため原子核を古典的に取り扱うことがよい近似になるが、水素のように軽い原子ではその量子効果が化学反応に重要な役割をはたす。特にトンネル効果は水素移動反応や、プロトン移動反応で重要になる。しかし、原子核を量子的に扱うシミュレーションは膨大な計算コストを要するために非常に小さな分子に限られているため、AIMD法の枠組みで適切にトンネル効果を見積もる手法が求められている。本研究ではトンネル効果を考慮する方法として、Makri-Millerの半古典法を採用した。Makri-Millerの半古典法はシンプルかつ計算コストも大きくないことから、大きな分子や計算コストを要する電子励起状態への適用が期待できる方法である。これまではあらかじめ決定したポテンシャル関数を用いて応用計算が行われてきたが、AIMD法と組合せ、on-the-flyでポテンシャルエネルギーを計算することによって、さらに汎用性の高い手法になる。Makri-Millerの半古典法をAIMDコードに実装し、アンモニアの傘反転反応とマロンアルデヒドの分子内水素移動反応へ適用した。シミュレーションの初期条件、トンネル経路、転回点の決定について適切な条件を検証し、トンネル分裂の計算を行なった。計算結果は定量的に実験値を再現し、トンネル分裂を低コストで見積もる手法の開発に成功した。本研究の成果は近日Journal of Computational Chemistryへの投稿を予定している。
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会议论文
Ab initio拘束分子動力学法によるアゾベンゼンの光異性化機構の解明1:S1(nπ^*)状態
用从头算约束分子动力学方法阐明偶氮苯的光异构化机理1:S1(nπ^*)态
DOI:
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发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
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作者:
[槇田祐輔, Yasushi Ishihama Bioorg. Med. Chem. Left, Takeshi Takeda, T. Kawashima, 大谷優介]
通讯作者:
大谷優介
Ab initio molecular dynamics simulation of photoisomerization in azoben zene in the nπ^* state
nπ^* 态偶氮苯光异构化从头算分子动力学模拟
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
The Journal of Chemical Physics 131
影响因子:
--
作者:
[Y.Higuchi, et al., Yuji Higuchi, 樋口祐次, 樋口祐次, 樋口祐次, 大谷優介]
通讯作者:
大谷優介
Ab initio分子動力学法によるアゾベンゼンnπ^*励起の光異性化機構の解明
利用从头算分子动力学方法阐明偶氮苯 nπ^* 激发的光异构化机理
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Y.Higuchi, et al., Yuji Higuchi, 樋口祐次, 樋口祐次, 樋口祐次, 大谷優介, 大谷優介]
通讯作者:
大谷優介
変形・破壊の分子ダイナミクスがもたらす力学作用と光の相互変換
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批准号:23K23293
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2024
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负责人:大谷 優介
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依托单位:
変形・破壊の分子ダイナミクスがもたらす力学作用と光の相互変換
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批准号:22H02025
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.74万
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财政年份:2022
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负责人:大谷 優介
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依托单位:
海外基金