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ヒストンH3バリアントとその相互作用因子によるクロマチン形成機構の解析

ヒストンH3バリアントとその相互作用因子によるクロマチン形成機構の解析
组蛋白H3变体染色质形成机制及其相互作用因素分析
批准号:
09J04280
负责人:
越阪部 晃永
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究の目的は、ヒストンH3のバリアントやそれらと相互作用する因子群を、生化学的および構造生物学的手法を用いて解析し、H3バリアントおよびそれらの相互作用因子群によるクロマチン構造形成のメカニズムを明らかにすることである。これまでに、ヒト由来のH3について、8つのバリアントが報告されているが、それらのクロマチン形成に関する詳細な役割は未だ明らかにされていない。そこで、H3バリアントの生体内における特異的な機能発現は、それぞれの相互作用因子群によってなされていると考え、H3バリアントと相互作用する因子群を、リコンビナントヒストンを用いたプロテオーム解析法により探索した。その結果、新規ピストン相互作用因子としてヒトSPT2を同定した。ヒトSPT2は出芽酵母の転写因子SPT2と共通するSpt2ドメインを有するタンパク質であるが、機能未知のタンパク質であった。そこで、SPT2の機能解析を行うために、リコンビナントタンパク質として精製したヒトSPT2を用いた生化学的解析を行った。その結果、精製したヒトSPT2はコアヒストンと直接相互作用し、ヌクレオソームの形成を促進した。また、ヒトSPT2はDNAとも直接結合し、特に分岐したDNA基質に優先的に結合した。さらに、HeLa細胞を用いた免疫染色実験を行い、SPT2の局在解析を行った。その結果、SPT2は核小体領域に局在し、特にrRNAの転写を行うRNAポリメラーゼIと共局在した。次に、SPT2の生体内での機能を解析するために、SPT2欠損ニワトリDT40細胞を樹立し、細胞生物学的解析を行った。その結果、SPT2欠損細胞がRNAポリメラーゼIの阻害剤に対して著しく感受性を示した。以上の結果から、新規ヒストン相互作用因子として同定したSPT2が、これまで不明な点が多かった核小体領域のクロマチンのダイナミクスに関与することが考えられた。
英文摘要
本研究の目的は、ヒストンH3のバリアントやそれらと相互作用する因子群を、生化学的および構造生物学的手法を用いて解析し、H3バリアントおよびそれらの相互作用因子群によるクロマチン構造形成のメカニズムを明らかにすることである。これまでに、ヒト由来のH3について、8つのバリアントが報告されているが、それらのクロマチン形成に関する詳細な役割は未だ明らかにされていない。そこで、H3バリアントの生体内における特異的な機能発現は、それぞれの相互作用因子群によってなされていると考え、H3バリアントと相互作用する因子群を、リコンビナントヒストンを用いたプロテオーム解析法により探索した。その結果、新規ピストン相互作用因子としてヒトSPT2を同定した。ヒトSPT2は出芽酵母の転写因子SPT2と共通するSpt2ドメインを有するタンパク質であるが、機能未知のタンパク質であった。そこで、SPT2の機能解析を行うために、リコンビナントタンパク質として精製したヒトSPT2を用いた生化学的解析を行った。その結果、精製したヒトSPT2はコアヒストンと直接相互作用し、ヌクレオソームの形成を促進した。また、ヒトSPT2はDNAとも直接結合し、特に分岐したDNA基質に優先的に結合した。さらに、HeLa細胞を用いた免疫染色実験を行い、SPT2の局在解析を行った。その結果、SPT2は核小体領域に局在し、特にrRNAの転写を行うRNAポリメラーゼIと共局在した。次に、SPT2の生体内での機能を解析するために、SPT2欠損ニワトリDT40細胞を樹立し、細胞生物学的解析を行った。その結果、SPT2欠損細胞がRNAポリメラーゼIの阻害剤に対して著しく感受性を示した。以上の結果から、新規ヒストン相互作用因子として同定したSPT2が、これまで不明な点が多かった核小体領域のクロマチンのダイナミクスに関与することが考えられた。
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会议论文
Structural feature of the CENP-A nucleosome in the vertebrate centro-mere.
脊椎动物着丝粒中 CENP-A 核小体的结构特征。
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [堀哲也, 立和名博昭, 越阪部晃永, 大川克也, 小布施力史, 胡桃坂仁志, 深川竜郎]
通讯作者: 深川竜郎
Biochemical and cell biological analyses of a novel histone interacting factor, SPT2
新型组蛋白相互作用因子 SPT2 的生化和细胞生物学分析
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [Akihisa Osakabe, Hiroaki Tachiwana, Tstsuya Hori, et al.]
通讯作者: et al.
セントロメア特異的なCENP-Aヌクレオソームの生化学的解析
着丝粒特异性 CENP-A 核小体的生化分析
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [立和名博昭, 川口紘一郎, 越阪部晃永, 志賀達也, 香川亘, 胡桃坂仁志]
通讯作者: 胡桃坂仁志
"Histone chaperone activity of a novel histone interacting factor SPT2"
“新型组蛋白相互作用因子 SPT2 的组蛋白伴侣活性”
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [Shikata M, Kato T, Shibata E and Sato H, Tatsuo Fukagawa, 甲山哲生,堀川千佳,川合靜,四方恵,佐藤宏明, 堀哲也, 佐藤宏明, Osakabe,A.]
通讯作者: Osakabe,A.
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    クロマチンリモデリングを介したトランスポゾン自己同一性確立と喪失機構の解明
    • 批准号:
      24K02002
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      越阪部 晃永
    • 依托单位:
    高次クロマチン形成の構造生物学的解析
    • 批准号:
      24870027
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
    • 资助金额:
      $1.91万
    • 财政年份:
      2012
    • 负责人:
      越阪部 晃永
    • 依托单位:
    海外基金