高次クロマチン形成の構造生物学的解析
高阶染色质形成的结构生物学分析
基本信息
- 批准号:24870027
- 负责人:
- 金额:$ 1.91万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
- 财政年份:2012
- 资助国家:日本
- 起止时间:2012-08-31 至 2014-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究の目的は、リンカーヒストンタンパク質H1の高次クロマチン形成における機能を構造生物学的手法によって明らかにすることである。真核生物において、長大なゲノムDNAは核内のタンパク質群とクロマチンを形成し、核内に収納される。クロマチンは主にヒストンタンパク質(H1、H2A、H2B、H3、H4)とDNAからなり、各2分子のコアヒストン(H2A、H2B、H3、H4)によって形成されるヒストン8量体にDNAが巻き付いたヌクレオソームが基本単位となる。さらに、ヌクレオソーム間のリンカーDNAにリンカーヒストンH1が結合し、高次に折り畳まれたクロマチンを形成する。一方で、クロマチンはダイナミックに構造変換を起こすことが知られており、遺伝子発現の調節のみならず、DNAの複製、修復、組換えなど様々なDNA機能発現と密接に関与していることが示され、近年注目されている。このようなクロマチンのダイナミクスはリンカーヒストンが結合した高次のクロマチン構造形成によって成立すると考えられており、H1が結合したヌクレオソーム(クロマトソーム)の立体構造を明らかにすることは非常に重要である。そこで本研究では、クロマトソームのX線立体構造を明らかにするために、申請者らの生化学的解析によってクロマトソームの形成に適した長さにデザインしたDNAを用いて、ヌクレオソームの試験管内再構成を行った。再構成したヌクレオソームにリンカーヒストンシャペロンNap1を用いてH1を結合させ、クロマトソームの形成を行った。その後、分取用電気泳動装置プレップセルによってクロマトソームの高純度精製を行った。精製したクロマトソームを用いて、ハンギングドロップ蒸気拡散法によって結晶化を行った。その結果、クロマトソームの単結晶を得ることに成功した。
The purpose of this study is to use the high-order クロマチン form of the のンカーヒストンタンパクquality H1 It is a method of functional and structural biology. Eukaryotes are formed, DNA is grown, nuclei are stored, and nuclei are stored.クロマチンは主にヒストンタンパク (H1, H2A, H2B, H3, H4) and DNA からなり, each 2 molecules of のコアヒストン ( H2A, H2B, H3, H4) によってforms されるヒストン8quantity body にDNAが巻きFU いたヌクレオソームがbasic unit となる.さらに、ヌクレオソーム间のリンカーDNAにリンカーヒストンH1がcombinationし, high-order にfoldり畳まれたクロマチンをformed する. D NA's replication, repair, and replacement of DNA functions are closely related to each other and have attracted much attention in recent years.このようなクロマチンのダイナミクスはリンカーヒストンがcombinationした高考のクロマチンstructural formationによってEstablishmentすると考The combination of H1 and H1 The three-dimensional structure of ーム) is very important.そこでThis research では, クロマトソームのX-ray three-dimensional structure を明らかにするために, applicant らのbiochemical analysis によってクThe ロマトソームの formed the long さにデザインしたDNAを using the いて, ヌクレオソームの test tube to reconstruct the を行った. Reconstructed Na p1を uses いてH1を combined with させ and クロマトソームの to form を行った. After that, the electrophoresis device used for dispensing is high-purity purified electrophoresis device. Refined したクロマトソームを uses いて, ハンギングドロップ steamed 気拡san method によって crystallization を行った.そのRESULTS, クロマトソームの単 Crystallization をget ることに Success した.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Nap1 regulates proper CENP-B binding to nucleosomes.
- DOI:10.1093/nar/gks1464
- 发表时间:2013-03-01
- 期刊:
- 影响因子:14.9
- 作者:Tachiwana H;Miya Y;Shono N;Ohzeki J;Osakabe A;Otake K;Larionov V;Earnshaw WC;Kimura H;Masumoto H;Kurumizaka H
- 通讯作者:Kurumizaka H
新規ヒストン相互作用因子hsSpt2の核小体クロマチンダイナミクスにおける機能
新型组蛋白相互作用因子 hsSpt2 在核仁染色质动力学中的功能
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:越阪部晃永;立和名博昭;高久誉大;堀哲也;小布施力史;木村宏;深川竜郎;胡桃坂仁志
- 通讯作者:胡桃坂仁志
Vertebrate Spt2 is a novel nucleolar histone chaperone that assists in ribosomal DNA transcription
- DOI:10.1242/jcs.112623
- 发表时间:2013-03-15
- 期刊:
- 影响因子:4
- 作者:Osakabe, Akihisa;Tachiwana, Hiroaki;Kurumizaka, Hitoshi
- 通讯作者:Kurumizaka, Hitoshi
リンカーヒストンH1サブタイプを含むクロマトソームの生化学的解析
含有接头组蛋白 H1 亚型的染色体的生化分析
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:越阪部晃永;加藤大貴;高久誉大;町田晋一;林田亮太;立和名博昭;胡桃坂仁志
- 通讯作者:胡桃坂仁志
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越阪部 晃永其他文献
Differential roles of Cdc7-Claspin in regulation of DNA replication in cancer and mon-cancer cells
Cdc7-Claspin 在调节癌细胞和单癌细胞 DNA 复制中的不同作用
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- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
宇理須 恒雄;佐久間 哲史;高田 望;竹中 繁織;小澤 岳昌;吉村 英哲;胡桃坂 仁志;越阪部 晃永;原田 昌彦;束田 裕一;宮成 悠介;塩見 美喜子;大西 遼;正井久雄 - 通讯作者:
正井久雄
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- DOI:
- 发表时间:
2010 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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竹内 康造
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“使用基因破坏的细胞对组蛋白变体 H2A.Z 亚型进行功能分析”
- DOI:
- 发表时间:
2010 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Suzuki;A;越阪部 晃永;竹内 康造;香川 尚子;北村 大志;松田 涼 - 通讯作者:
松田 涼
"Creation of chromosomes containing neocentromere in chickin DT40 cells"
“在鸡 DT40 细胞中创建含有新着丝粒的染色体”
- DOI:
- 发表时间:
2010 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Suzuki;A;越阪部 晃永;竹内 康造;香川 尚子;北村 大志;松田 涼;Shang,W.H - 通讯作者:
Shang,W.H
ナノバイオ・メディシン―遺伝子工学の革命ゲノム編集
纳米生物医学 - 革命性的基因工程基因组编辑
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
宇理須 恒雄;佐久間 哲史;高田 望;竹中 繁織;小澤 岳昌;吉村 英哲;胡桃坂 仁志;越阪部 晃永;原田 昌彦;束田 裕一;宮成 悠介;塩見 美喜子;大西 遼;原田昌彦 - 通讯作者:
原田昌彦
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$ 1.91万 - 项目类别:
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利用更高质量的人iPS细胞建立成熟的心肌细胞分化系统
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$ 1.91万 - 项目类别:
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Regulation of gene expression by histone chaperones
组蛋白伴侣对基因表达的调节
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Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ニューロン成熟過程におけるリンカーヒストンH1による協調的遺伝子発現制御機構
神经元成熟过程中接头组蛋白H1的协同基因表达控制机制
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16J09038 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 1.91万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Generation of higher-quality iPS cells
产生更高质量的 iPS 细胞
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16K19429 - 财政年份:2016
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$ 1.91万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Structural study of the higher order chromatin structure formed by HP1BP3
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$ 1.91万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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$ 1.91万 - 项目类别:
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26850230 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 1.91万 - 项目类别:
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