糖質加水分解酵素における多糖分岐構造の多様な認識メカニズム

碳水化合物水解酶中多糖支链结构的多种识别机制

基本信息

  • 批准号:
    09J06099
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2009 至 2010
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では、分岐構造を含む多糖であるβ-1,3/1,6グルカン、キシログルカンをそれぞれ基質とするβ-1,3グルカナーゼ、キシログルカナーゼを研究対象とし、その基質特異性、分解特性を詳細に分析することを目的とした。昨年度までに、GHファミリー55に属するβ-1,3/1,6グルカナーゼ、GHファミリー74に属するキシログルカナーゼの機能解析、X線結晶構造解析をおこなってきた。本年度は、特別研究員海外派遣事業の一環として、スウェーデン農業科学大学への半年間の研究派遣を行い、GHファミリー16に属するβ-1,3/1,6グルカナーゼLam16Aの変異体酵素を用いたX線結晶構造解析を主に行った。β-1,3結合のみを含むラミナリペンタオースおよび、β-1,3結合とβ-1,6結合を含むリガンドP4との複合体構造においては、サブサイト-1と+1を占めるグルコース残基間のグリコシド結合がβ-1,3結合であるのに対し、β-1,3結合とβ-1,4結合を含むリガンドであるP3との複合体では同じ部位の結合がβ-1,4結合であった。また、サブサイト+1に結合したグルコース残基はサブサイト-1/+1間の結合がβ-1,3結合とβ-1,4結合の場合とではグルコースの六員環の向き(裏表)が異なることがわかった。本酵素はサブサイト-2/-1間において!-1,3結合したグルコース残基のみを厳密に認識する事が知られていることから、活性中心に異なるタイプのグリコシド結合を受け入れられることは本酵素の加水分解特性に大きく影響していると考えられる。また、異なるグリコシド結合を活性中心に受け入れた構造の例は、基質の末端特異的に働く糖質加水分解酵では複数知られているが、多糖に対してランダムに加水分解を行なうエンド型の糖質加水分解酵素においては、Lam16Aが初めての例となる。
In this study, polysaccharides and bifurcations were made, including polysaccharides, polysaccharides, bifurcations, polysaccharides, bifurcations, polysaccharides, polysaccharides, bifurcations, polysaccharides, bifurcations, bifurcations, polysaccharides, polysaccharides, bifurcations, bifurcations, polysaccharides, Last year, GH equipment 55 was classified as "β-1", "1", "6", and "74", which was analyzed by computer and X-ray analysis. This year, special research staff overseas dispatched to the University of Agricultural Sciences for more than half a year to study the dispatch line, and the GH program belongs to the β-1 chain. The main bank was analyzed by X-ray diffraction analysis of Lam16A enzyme enzymes. The combination of β-1primer 3 and β-1Mol 3 combined with β-1Met 3 and β-1Mol 3 with β-1Mol 6 combined with the complex of P4 and P4 cubes to make the complex of antioxidants, the combination of β-1 and the residue of β-1, and the combination of β-1 and β-1, respectively. The combination of β-1pyrine 3 and β-1pyrine 4 combined with the combination of β-1pyrine and β-1pyrine and the combination of β-1pyrine and β-1pyrine. The combination of β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, β-1, and so on. This enzyme is highly sensitive to the molecular weight of the enzyme, the activity center, the activity center, the enzyme, the enzyme. The combination of the active center and the active center is affected by the addition of the enzyme at the end of the enzyme, the carbohydrate added to the hydrolytic enzyme at the end of the enzyme, the complex of the hydrolytic enzyme, the polysaccharide, the hydrolytic enzyme, the hydrolytic enzyme, the sugar, the hydrolytic enzyme, the hydrolytic enzyme and the hydrolytic enzyme.

项目成果

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专著数量(0)
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会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystal Structure of endo-glucanase PcCel45A from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
担子菌 Phanerochaete chrysosporium 内切葡聚糖酶 PcCel45A 的晶体结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nakajima K;Komiyama Y;Hojo H;Ohba S;Yano F;Nishikawa N;Ihara S;Aburatani H;Takato T;Chung UI.;中島慶治;北條宏徳;Ishida Takuya;Ishida Takuya;石田卓也;Ishida Takuya
  • 通讯作者:
    Ishida Takuya
Crystal Structure of Glycoside Hydrolase Family 55 β-1,3-Glucanase from the Basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
  • DOI:
    10.1074/jbc.m808122200
  • 发表时间:
    2009-04-10
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Ishida, Takuya;Fushinobu, Shinya;Samejima, Masahiro
  • 通讯作者:
    Samejima, Masahiro
担子菌Phanerochaete chrysosporium由来エンドグルカナーゼPcCel45Aの結晶構造解析
担子菌 Phanerochaete chrysosporium 内切葡聚糖酶 PcCel45A 的晶体结构分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nakajima K;Komiyama Y;Hojo H;Ohba S;Yano F;Nishikawa N;Ihara S;Aburatani H;Takato T;Chung UI.;中島慶治;北條宏徳;Ishida Takuya;Ishida Takuya;石田卓也
  • 通讯作者:
    石田卓也
Crystallization of selenomethionyl exo-β-1,3-galactanase from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
Crystal structure of β-1,3-glucanase Lam55A from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
担子菌 Phanerochaete chrysosporium β-1,3-葡聚糖酶 Lam55A 的晶体结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nakajima K;Komiyama Y;Hojo H;Ohba S;Yano F;Nishikawa N;Ihara S;Aburatani H;Takato T;Chung UI.;中島慶治;北條宏徳;Ishida Takuya;Ishida Takuya;石田卓也;Ishida Takuya;Ishida Takuya
  • 通讯作者:
    Ishida Takuya
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  • 通讯作者:
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    0
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