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糖質加水分解酵素における多糖分岐構造の多様な認識メカニズム

糖質加水分解酵素における多糖分岐構造の多様な認識メカニズム
碳水化合物水解酶中多糖支链结构的多种识别机制
批准号:
09J06099
负责人:
石田 卓也
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2010

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究では、分岐構造を含む多糖であるβ-1,3/1,6グルカン、キシログルカンをそれぞれ基質とするβ-1,3グルカナーゼ、キシログルカナーゼを研究対象とし、その基質特異性、分解特性を詳細に分析することを目的とした。昨年度までに、GHファミリー55に属するβ-1,3/1,6グルカナーゼ、GHファミリー74に属するキシログルカナーゼの機能解析、X線結晶構造解析をおこなってきた。本年度は、特別研究員海外派遣事業の一環として、スウェーデン農業科学大学への半年間の研究派遣を行い、GHファミリー16に属するβ-1,3/1,6グルカナーゼLam16Aの変異体酵素を用いたX線結晶構造解析を主に行った。β-1,3結合のみを含むラミナリペンタオースおよび、β-1,3結合とβ-1,6結合を含むリガンドP4との複合体構造においては、サブサイト-1と+1を占めるグルコース残基間のグリコシド結合がβ-1,3結合であるのに対し、β-1,3結合とβ-1,4結合を含むリガンドであるP3との複合体では同じ部位の結合がβ-1,4結合であった。また、サブサイト+1に結合したグルコース残基はサブサイト-1/+1間の結合がβ-1,3結合とβ-1,4結合の場合とではグルコースの六員環の向き(裏表)が異なることがわかった。本酵素はサブサイト-2/-1間において!-1,3結合したグルコース残基のみを厳密に認識する事が知られていることから、活性中心に異なるタイプのグリコシド結合を受け入れられることは本酵素の加水分解特性に大きく影響していると考えられる。また、異なるグリコシド結合を活性中心に受け入れた構造の例は、基質の末端特異的に働く糖質加水分解酵では複数知られているが、多糖に対してランダムに加水分解を行なうエンド型の糖質加水分解酵素においては、Lam16Aが初めての例となる。
英文摘要
本研究では、分岐構造を含む多糖であるβ-1,3/1,6グルカン、キシログルカンをそれぞれ基質とするβ-1,3グルカナーゼ、キシログルカナーゼを研究対象とし、その基質特異性、分解特性を詳細に分析することを目的とした。昨年度までに、GHファミリー55に属するβ-1,3/1,6グルカナーゼ、GHファミリー74に属するキシログルカナーゼの機能解析、X線結晶構造解析をおこなってきた。本年度は、特別研究員海外派遣事業の一環として、スウェーデン農業科学大学への半年間の研究派遣を行い、GHファミリー16に属するβ-1,3/1,6グルカナーゼLam16Aの変異体酵素を用いたX線結晶構造解析を主に行った。β-1,3結合のみを含むラミナリペンタオースおよび、β-1,3結合とβ-1,6結合を含むリガンドP4との複合体構造においては、サブサイト-1と+1を占めるグルコース残基間のグリコシド結合がβ-1,3結合であるのに対し、β-1,3結合とβ-1,4結合を含むリガンドであるP3との複合体では同じ部位の結合がβ-1,4結合であった。また、サブサイト+1に結合したグルコース残基はサブサイト-1/+1間の結合がβ-1,3結合とβ-1,4結合の場合とではグルコースの六員環の向き(裏表)が異なることがわかった。本酵素はサブサイト-2/-1間において!-1,3結合したグルコース残基のみを厳密に認識する事が知られていることから、活性中心に異なるタイプのグリコシド結合を受け入れられることは本酵素の加水分解特性に大きく影響していると考えられる。また、異なるグリコシド結合を活性中心に受け入れた構造の例は、基質の末端特異的に働く糖質加水分解酵では複数知られているが、多糖に対してランダムに加水分解を行なうエンド型の糖質加水分解酵素においては、Lam16Aが初めての例となる。
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会议论文
Crystal Structure of endo-glucanase PcCel45A from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
担子菌 Phanerochaete chrysosporium 内切葡聚糖酶 PcCel45A 的晶体结构
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [Nakajima K, Komiyama Y, Hojo H, Ohba S, Yano F, Nishikawa N, Ihara S, Aburatani H, Takato T, Chung UI., 中島慶治, 北條宏徳, Ishida Takuya, Ishida Takuya, 石田卓也, Ishida Takuya]
通讯作者: Ishida Takuya
DOI: 10.1074/jbc.m808122200
发表时间: 2009-04-10
期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子: 4.8
作者: [Ishida, Takuya, Fushinobu, Shinya, Samejima, Masahiro]
通讯作者: Samejima, Masahiro
担子菌Phanerochaete chrysosporium由来エンドグルカナーゼPcCel45Aの結晶構造解析
担子菌 Phanerochaete chrysosporium 内切葡聚糖酶 PcCel45A 的晶体结构分析
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [Nakajima K, Komiyama Y, Hojo H, Ohba S, Yano F, Nishikawa N, Ihara S, Aburatani H, Takato T, Chung UI., 中島慶治, 北條宏徳, Ishida Takuya, Ishida Takuya, 石田卓也]
通讯作者: 石田卓也
DOI: 10.1107/s1744309109043395
发表时间: 2009-12-01
期刊: ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS
影响因子: 0.9
作者: [Ishida, Takuya, Fujimoto, Zui, Samejima, Masahiro]
通讯作者: Samejima, Masahiro
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    リン酸酸素同位体比の革新的活用による肥料由来レガシーリンの溶出機構・輸送量評価
    • 批准号:
      24K01896
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.81万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      石田 卓也
    • 依托单位:
    脳領域間の因果関係を考慮に入れたネットワーク解析によるうつ病のrTMS治療機序の解明
    • 批准号:
      23K06992
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $1.75万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      石田 卓也
    • 依托单位:
    海外基金