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現生人類集団の拡大と多様化におけるクローン病原因ゲノム領域の進化プロセス解明

阐明现代人类群体扩张和多样化过程中克罗恩病基因组区域的进化过程

基本信息

批准号：
09J07453
负责人：
中込滋樹
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Kitasato University (2010)The University of Tokyo (2009)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2009
资助国家：
日本
起止时间：
2009 至 2010
项目状态：
已结题

项目摘要

クローン病は腸の粘膜において慢性的な炎症が生じる炎症性腸疾患である。ヨーロッパ人における発症率が顕著に高いため、これまでヨーロッパ人の患者と健常者を用いた全ゲノム相関解析により30以上のクローン病原因候補遺伝子座が同定されている。しかし、それら疾患アレルは日本人を含む東アジア人ではクローン病に関係しないことが示されている。このことから、これまで同定されてきた遺伝子座ではクローン病アレルがヨーロッパ人でのみ維持されてきた可能性がある。そこで本研究では、ヨーロッパ人においてクローン病に関係することが示されている8遺伝子座(NOD2,IL23R,TNFSF15,ATG16L1,SLC22A4,SLC22A5,IRGM,10q21)に着目し、アフリカ人、ヨーロッパ人、東アジア人の各地域集団における多型データを基に進化学的解析を行った。その結果、NOD2遺伝子座ではクローン病アレルがヨーロッパ人集団に特異的に拡がっていることが示された。さらに、その多くがヨーロッパ人集団でのみ高い頻度で存在するハプロタイプ(H1)に連鎖していることも示された。そこでH1が自然選択と遺伝的浮動のどちらによって拡がったのかを検証するために、人類集団の移動及び拡散の歴史をシミュレーションにより再現し、ハプロタイプパターンを調べた。それにより、ヨーロッパ人におけるH1の頻度は中立条件下で期待される頻度よりも有意に高いことが示された。このことから、H1は自然選択によりヨーロッパ人に拡がり、それに伴ってクローン病アレルも維持されてきたとのではないかと考えられる。そして、クローン病の発症率がヨーロッパ人において顕著に高いことを考えると、本研究における結果は人類集団における適応進化の1つの副産物として、現代ではクローン病の発症リスクがもたらされたことを示唆している。

Chronic inflammatory bowel disease The incidence rate of the disease is higher in the patients and the healthy ones. The correlation analysis is more than 30. The candidate of the cause of the disease is consistent with the analysis. The Japanese people are not happy with the disease, but they are happy with the disease. This is the first time I've ever seen a person who's been in a relationship with someone else. In this study, we demonstrated the genetic analysis of 8 loci (NOD2, IL23R, TNFSF15, ATG16L1, SLC22A4, SLC22A5,IRGM, 10q21) for the polytype of human in each region. As a result, NOD2 gene loci can be used to detect the presence of a disease in a group of individuals. In addition, there are many kinds of chain reactions in the human population. H1 is a natural selection and inheritance of floating, shifting, and detecting human populations. It is a natural selection and inheritance of floating, shifting, and reconstructing human populations. The frequency of H1 is expected to be high under neutral conditions. This is the first time I've ever been to a hospital. The results of this study indicate that the incidence of disease in modern humans is a by-product of evolutionary adaptation.