Genome-wide mapping of cis-regulatory elements conserved in vertebrates

脊椎动物中保守的顺式调控元件的全基因组图谱

基本信息

  • 批准号:
    21200064
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 19.8万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
  • 财政年份:
    2009
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2009 至 2011
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

We performed cis-regulatory analyses of genes involved in development and disease in a genome-wide manner, using comparative genomics approach and an efficient transgenesis technique in Xenopus. Conserved enhancers were identified in a variety of genes including Pax family and Polycomb-related genes. Furthermore, comparative functional analysis between the vertebrate and amphioxus cis-regulatory elements revealed that silencer innovation, rather than enhancer degeneration, was crucial for the diversification of paralog expression during vertebrate evolution.
我们进行了顺式调控的基因参与的发展和疾病在全基因组的方式,使用比较基因组学方法和有效的转基因技术在非洲爪蟾。保守的增强子在多种基因中被鉴定,包括Pax家族和Polycomb相关基因。此外,脊椎动物和文昌鱼的顺式调控元件之间的比较功能分析表明,沉默创新,而不是增强子退化,是至关重要的在脊椎动物进化过程中的parabolic表达的多样化。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
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会议论文数量(0)
专利数量(0)
Functional analysis of the histone H3K27 methyltransferase and demethylase in Xenopus embryonic development
非洲爪蟾胚胎发育中组蛋白 H3K27 甲基转移酶和去甲基化酶的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kawaguchi;A
  • 通讯作者:
    A
Evolution of a fail-safe regulatory system for kidney development
肾脏发育自动防故障监管系统的演变
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ochi;H
  • 通讯作者:
    H
A fail-safe regulatory system generated by genome duplications for kidney development
由基因组复制产生的肾脏发育的自动防故障调节系统
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ochi;H.
  • 通讯作者:
    H.
Cis-regulatory mechanisms controlling Sixl expression in the preplacodal region and sensory placodes
控制前基板区和感觉基板中 Sixl 表达的顺式调节机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tobita;S.;Yoshihara;T.;Kobayashi;A.;Ichikawa;K.;Hosaka;M.;Takeuchi;T;Inoue T;佐藤滋
  • 通讯作者:
    佐藤滋
パラログ形成にともなうシス調節機構の進化
顺式调控机制的演变与旁系同源物的形成
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    越智陽城
  • 通讯作者:
    越智陽城
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    KAWAGUCHI Akane;OCHI Haruki;SUODU Norihiro;OGINO Hajime;福田憲
  • 通讯作者:
    福田憲

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    $ 19.8万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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