Genome-wide mapping of cis-regulatory elements conserved in vertebrates
Genome-wide mapping of cis-regulatory elements conserved in vertebrates
批准号:
21200064
负责人:
OGINO Hajime
金额:
$19.8万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2011
中文摘要
我们进行了顺式调控的基因参与的发展和疾病在全基因组的方式,使用比较基因组学方法和有效的转基因技术在非洲爪蟾。保守的增强子在多种基因中被鉴定,包括Pax家族和Polycomb相关基因。此外,脊椎动物和文昌鱼的顺式调控元件之间的比较功能分析表明,沉默创新,而不是增强子退化,是至关重要的在脊椎动物进化过程中的parabolic表达的多样化。
英文摘要
We performed cis-regulatory analyses of genes involved in development and disease in a genome-wide manner, using comparative genomics approach and an efficient transgenesis technique in Xenopus. Conserved enhancers were identified in a variety of genes including Pax family and Polycomb-related genes. Furthermore, comparative functional analysis between the vertebrate and amphioxus cis-regulatory elements revealed that silencer innovation, rather than enhancer degeneration, was crucial for the diversification of paralog expression during vertebrate evolution.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Evolutionary divergence and conservation of cis-regulatory elements in paralog formation
旁系同源形成中顺式调控元件的进化分歧和保守
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ochi, H]
通讯作者:
H
ゲノム倍化が引き起こす遺伝子発現調節機構の進化
基因组加倍引起的基因表达调控机制的进化
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tokuda, M., 荻野肇]
通讯作者:
荻野肇
The H3K27 demethylase, JMJD3, is essential for Xenopus eye development
H3K27 去甲基酶 JMJD3 对于非洲爪蟾眼睛发育至关重要
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kawaguchi, A]
通讯作者:
A
平成24年度末まで研究成果を公開。平成25年度より、異動先機関(長浜バイオ大学)にて新たに成果公開用のwebページを作成予定。
研究结果将在2012年底之前公开。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Pax2/5/8パラロググループのシス調節ネットワークの解析
Pax2/5/8旁系同源组的顺式调控网络分析
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jun Ohno, Kei Hiraki, 荻野 肇]
通讯作者:
荻野 肇
共 45 条
Analysis of gene co-option mechanisms involving epigenetic regulation
-
批准号:15K07082
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
-
资助金额:$3.24万
-
财政年份:2015
-
负责人:OGINO Hajime
-
依托单位:
The search for new developmental genes using a gene trap approach in Xenopus tropicalis
-
批准号:20579002
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
-
资助金额:$2.52万
-
财政年份:2008
-
负责人:OGINO Hajime
-
依托单位:
海外基金