細胞分化における高次遺伝子発現制御機構ネットワークの解明
阐明细胞分化过程中高阶基因表达控制机制的网络
基本信息
- 批准号:20016020
- 负责人:
- 金额:$ 4.99万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2009
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究プロジェクトでは筋分化において、これらの各イベントが複数のグループ遺伝子ごとにまとまって同調的に制御されていることを見出してきた。これらの骨格筋特異的な遺伝子はゲノム上にランダムに位置していた。このことは、これらの遺伝子群を時期特異的に一括して発現調節する高次のクロマチン構造制御システムが細胞内に存在する事を示唆する。我々はギガシークエンサーを応用した新たなアプローチを樹立し、バイアスなしにゲノムワイドなジーンクラスタリング現象の把握が可能となった。まず、両端がユニークにマウスゲノム上にマッピングされたものを解析対象としたところ、全読み取りタグ1500万に対し、700-800万のタグが該当した。これを遺伝子座近接情報として、解析を進めることとした。骨格筋分化サンプルとして、C2C12細胞を分化刺激し経時的に回収したものと、コントロールとしてNIH3T3を非筋肉細胞として用いた。その結果、骨格筋分化段階特異的な遺伝子座近接部位がゲノム上に存在すること、その多くが遺伝子のプロモーターもしくは他の制御領域に位置していることが明らかとなった。また、逆に細胞を問わず、常に他の遺伝子と近接している領域が存在しておりこれら領域がさまざまな遺伝子群の発現制御に関わっていることが示唆された。また興味深いことに現在アノテーション情報が付与されていない一方で、他の動物種であるヒト、ラットで保存性が高い領域が多く同定された。また、可視化による検討としてDNA-FISH により遺伝子座近接の検証を行った。予備実験の結果近接が3Cによって確認された筋クレアチンキナーゼ遺伝子座と筋アクチン1の遺伝子座の近接について評価した。その結果、骨格筋細胞のみ、両遺伝子座の近接が2-4%の割合で確認できたのに対し、非筋系ではゼロであった。次にこの形成にかかわる因子を探索したところ、Brg1クロマチンリモデリング因子の活性化を抑止した細胞では遺伝子近接現象が消失し、且つ骨格筋分化も抑制された。以上のことから、遺伝子座近接現象がクロマチン構造変換と密接に関わりながら骨格筋分化を制御していることが示唆された。
In this study, we found out that there was a difference between the two groups of individuals, and there was a difference between them. This is the first time that a person's body has been exposed to such a phenomenon. This is a time-specific event that involves the development and regulation of high-level cellular structures. We have to create a new website for you to view and view the content of the website. For example, if you want to buy a car, you can buy a car and buy a car. This is the first time I've ever been in a relationship with someone else. C2C12 cells were stimulated to differentiate into muscle cells, and NIH cells were stimulated to differentiate into muscle cells. As a result, there are many different types of DNA fragments in the vicinity of the skeleton, such as DNA fragments, DNA fragments and DNA fragments. In addition, in the case of the reverse cell, there are always other genes and close contacts in the field, which are related to the occurrence of the gene group. The interest of the people is deep, and the information of the people is given to one party, to another animal species, and to a high level of preservation. DNA-FISH is a method for detecting DNA in close proximity to a gene locus. The results of the preliminary study are as follows: 3C, 3C, The results showed that 2-4% of the joints of the skeletal muscle cells and the skeletal muscle cells were confirmed, and the joints of the non-skeletal muscle cells were confirmed. In order to explore the formation of these factors, Brg1 can inhibit the activation of these factors, and the phenomenon of cell proximity can be eliminated, and the differentiation of bone tendons can be inhibited. The above phenomenon of close contact between the structure and the skeleton is related to the control of the differentiation of the skeleton and tendon.
项目成果
期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Generation of a rat monoclonal antibody specific for brm
brm 特异性大鼠单克隆抗体的产生
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Okada;S.
- 通讯作者:S.
「骨格筋分化における高次クロマチン構造制御の解析.」
“骨骼肌分化中高阶染色质结构调控的分析。”
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hashimoto M.;et. al.;大川恭行
- 通讯作者:大川恭行
Production of a Rat Monoclonal Antibody Against Brg1
- DOI:10.1089/hyb.2009.0041
- 发表时间:2009-12-01
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ohkawa, Yasuyuki;Harada, Akihito;Tachibana, Taro
- 通讯作者:Tachibana, Taro
Production of a rat monoclonal antibody specific for Myf5.
Myf5 特异性大鼠单克隆抗体的生产。
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Harada A;Okada S;Odawara J;Kumamaru H;Saiwai H;Aoki M;Nakamura M;Nishiyama Y;Ohkawa Y.
- 通讯作者:Ohkawa Y.
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
大川 恭行其他文献
Cd2 incorporates H3.3 to mark myogenic genes
Cd2整合H3.3来标记生肌基因
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Yutaka Kuroda;Alam M. Khan;Monirul M Islam;大川 恭行 - 通讯作者:
大川 恭行
Expansion and contraction of the olfactory receptor gene universe in mammals: –Superior sense of smell in African elephants?
哺乳动物嗅觉受体基因宇宙的扩张和收缩:
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
冨川 順子;前原 一満;岡村 浩司;林 恵子;阿久津 英憲;田中 智;大川 恭行;秦 健一郎;中林 一彦;Yoshihito Niimura - 通讯作者:
Yoshihito Niimura
Chd2 incorporates H3.3 to mark myogenic genes.
Chd2 整合了 H3.3 来标记生肌基因。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Tanaka T;Umemori T;Endo S;Muramatsu S;Kanemaki M;Kamimura Y;Obuse C;Araki H;大川 恭行 - 通讯作者:
大川 恭行
Semi-extractable feature as the hallmark of nuclear body-associated architectural long ncRNAs
半可提取特征是核体相关结构长 ncRNA 的标志
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Taro Mannen;Naoki Goshima;and Tetsuro Hirose;大川 恭行;廣瀬哲郎 - 通讯作者:
廣瀬哲郎
ヒストンH3バリアントの選択的取り込みによる組織特異的な遺伝子発現制御
通过选择性掺入组蛋白 H3 变体进行组织特异性基因表达调控
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
原田 哲仁;小松 哲郎;前原 一満;近藤 友佳理;田中 かおり;桑門 温子;佐藤 優子;木村 宏;林 克彦;小野 悠介;竹本 龍也;胡桃坂 仁志;大川 恭行 - 通讯作者:
大川 恭行
大川 恭行的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('大川 恭行', 18)}}的其他基金
結合オミクスによる骨格筋組織再生機序の解明
使用耦合组学阐明骨骼肌组织再生机制
- 批准号:
23H00372 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
非破壊的に生細胞のトランスクリプトームの経時変化を追跡する技術の開発
开发非破坏性追踪活细胞转录组随时间变化的技术
- 批准号:
22K19275 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
CHD2クロマチンリモデリング因子変異による無秩序遺伝子発現
CHD2 染色质重塑因子突变导致基因表达紊乱
- 批准号:
20012041 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相似国自然基金
基于Semaphorin 3C的内皮功能障碍在脓毒症相关急性肾损伤表型中的研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于少样本多模态学习的3C产品生产异常检测与分类研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
染色质重塑因子 BAF60b 在胰腺炎继发 3C 型
糖尿病中的作用机制和干预策略研究
- 批准号:HDMD24H030001
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
面向3C异构零部件装配的机器人复杂操作技能学习研究
- 批准号:62373225
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
氰醇酯类肠道病毒71型3C蛋白酶抑制剂的设计、合成及活性研究
- 批准号:82304314
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
车辆边缘计算网络低时延3C资源管理理论与关键技术研究
- 批准号:62301300
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
A型塞内卡病毒3C蛋白通过裂解FAM134B调控内质网稳态利于病毒复制的分子机制
- 批准号:32372975
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
融合空地协同模型训练与推理的智能物联网3C资源管理
- 批准号:n/a
- 批准年份:2023
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
蛋白磷酸酶1调节亚基3c(PPP1R3c)调控肝脏糖异生的作用及机制研究
- 批准号:82370810
- 批准年份:2023
- 资助金额:49.00 万元
- 项目类别:面上项目
胰腺星状细胞外泌体导致3c糖尿病胰岛β细胞功能受损的机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2022
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
エンドソームの膜蛋白輸送に着目した3C症候群の病態解明
重点关注内体膜蛋白转运的 3C 综合征病理学阐明
- 批准号:
23K14945 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
The responsibility of S and 3c genes for pathogenicity of feline infectious peritonitis virus
S和3c基因对猫传染性腹膜炎病毒致病性的作用
- 批准号:
23K05576 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Building a pan-Canadian Community of Collaboration: A Pharmacy Research Network (3C-PRN) to improve the detection, treatment, and control of hypertension
建立泛加拿大合作社区:药学研究网络 (3C-PRN),以改善高血压的检测、治疗和控制
- 批准号:
487829 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Miscellaneous Programs
Verification of AI based 3C resource utilization efficiency in 6G
6G中基于AI的3C资源利用效率验证
- 批准号:
22K17884 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Uncovering cellular substrates of 3C-like proteases to identify conserved virus-host interactions as antiviral targets
揭示 3C 样蛋白酶的细胞底物,以识别保守的病毒-宿主相互作用作为抗病毒靶点
- 批准号:
MR/X000885/1 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Research Grant
Excellence in Research: Ultrasensitive Electromagnetic Field Detectors Based on Quantum Defects in 3C Silicon Carbide and Cubic Boron Nitride
卓越研究:基于 3C 碳化硅和立方氮化硼量子缺陷的超灵敏电磁场探测器
- 批准号:
2101102 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Standard Grant
Small Molecule Inhibitors Against 3C-Like Protease of SARS-CoV-2
针对 SARS-CoV-2 3C 样蛋白酶的小分子抑制剂
- 批准号:
10670145 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
The structural basis of transcription factor 3C recruitment by N-myc
N-myc 招募转录因子 3C 的结构基础
- 批准号:
MR/V029975/1 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Research Grant
Small Molecule Inhibitors Against 3C-Like Protease of SARS-CoV-2
针对 SARS-CoV-2 3C 样蛋白酶的小分子抑制剂
- 批准号:
10238615 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别:
Small Molecule Inhibitors Against 3C-Like Protease of SARS-CoV-2
针对 SARS-CoV-2 3C 样蛋白酶的小分子抑制剂
- 批准号:
10463664 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 4.99万 - 项目类别: