Analysis of Sex-dependent Epigenome

性别依赖性表观基因组分析

• 批准号: 21221008
• 负责人: SHIOTA Kunio
• 金额: $ 133.37万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009-05-11 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21221008/
• 关键词: ゲノム; エピゲノム; ゲノムネットワーク; T-DMR; 性差; DNAメチル化; ヒストン修飾; 次世代シークエンス; ホルモン依存; 組織依存; エピジェネティクス; 性差DNAメチル化領域; ヒストンH1; 子宮筋腫; DNAメチル化プロフィール; 発生分化; 性依存性; 常染色体; 性染色体

What is known about the biology of sexual differences is that there are striking differences in the biological functions that can lead to human and animal diseases. Epigenetic systems are recognized as memory systems for inheritable gene functions. DNA methylation plays a role the main epigenetic regulation mechanism in mammals. A unique feature of the mammalian genome is that there are numerous tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs), which include genes and their regulatory elements. We have developed D-REAM, a genome-wide DNA methylation analysis method using a genome tiling array, for T-DMRs profiling with restriction tag-mediated amplification. This research project highlights the epigenome of tissues and cells in male and female respectively. We found that there are T-DMRs that are differentially methylated between male and female animals, other than those found in the sex chromosomes and the genomic regions related to sexual organs development.

关于性别差异的生物学，我们所知道的是，在可能导致人类和动物疾病的生物功能方面存在着惊人的差异。表观遗传系统被认为是遗传基因功能的记忆系统。DNA甲基化是哺乳动物主要的表观遗传调控机制.哺乳动物基因组的一个独特特征是存在许多组织依赖性和差异甲基化区域（T-DMR），其包括基因及其调控元件。我们已经开发了D-REAM，一种使用基因组平铺阵列的全基因组DNA甲基化分析方法，用于限制性标签介导的扩增的T-DMR分析。本研究项目重点研究男性和女性组织和细胞的表观基因组。我们发现，除了在性染色体和与性器官发育相关的基因组区域中发现的T-DMR之外，雄性和雌性动物之间存在差异甲基化的T-DMR。

项目成果

Trophoblast cell lineage in cloned mouse embryos

• DOI: 10.1111/j.1440-169x.2010.01173.x
• 发表时间: 2010-03
• 期刊: Development
• 影响因子: 4.6
• 作者: M. Oda;K. Shiota;Satoshi Tanaka

ポスト・エピジェネティクス時代のエピジェネティクス

后表观遗传学时代的表观遗传学

• 发表时间: 2013
• 作者: Agusa;T.;塩田邦郎
• 通讯作者: 塩田邦郎

タマゴとニワトリ、どちらが先か?エピジェネティクスからの回答

表观遗传学的答案是先有蛋还是先有鸡？

• 发表时间: 2009
• 作者: 本山秀明;東久美子;植村立;三宅隆之;平林幹啓;倉元隆之;飯塚芳徳;鈴木啓助;藤田秀二;塩田邦郎
• 通讯作者: 塩田邦郎

国際シンポジウムの主催 性差のエピジェネティクスの基礎から応用の情報交換と社会への発信を目指して、国際シンポジウム"Sex-Differences in Epigenetics and Epigenomics"を開催し、(中島ホール、東京大学フードサイエンス棟 2012年9月12日)、学生、大学院生、一般の研究者を対象に、性差に関するエピジェネティクスの重要性をアピールした。本研究プロジェクトメンバー(4名:八木、早川、中西、高杉)により成果の一部を発表した (学会発表15-18)。また、海外からDr.

赞助国际研讨会 举办了国际研讨会“表观遗传学和表观基因组学中的性别差异”，旨在交流性别差异的基础知识和应用的信息并向社会传播（东京大学食品科学楼中岛大厅， 2012）（2018 年 9 月 12 日），我们向学生、研究生和一般研究人员呼吁表观遗传学对于性别差异的重要性。

Epigenetic Assessment of Environmental Chemicals Detected in Maternal Peripheral and Cord Blood Samples

• DOI: 10.1262/jrd.11-034a
• 发表时间: 2011-08-01
• 期刊: JOURNAL OF REPRODUCTION AND DEVELOPMENT
• 影响因子: 1.8
• 作者: Arai, Yoshikazu;Ohgane, Jun;Shiota, Kunio
• 通讯作者: Shiota, Kunio