Analyses of genome diversity in the Ryukyu islanders. to reveal their phylogeny, morphology and adaptation.

琉球岛民基因组多样性分析。

• 批准号: 21370108
• 负责人: OOTA Hiroki
• 金额: $ 11.73万
• 依托单位: Kitasato University (2010-2011)The University of Tokyo (2009)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21370108/
• 关键词: 琉球諸島; 日本人の起源; 炎症性腸疾患; アルコール代謝; シャベル型切歯; 先島諸島; 歯牙形質; STR多型; アイヌ; 縄文人; 先島所等; 歯冠形質; クローン病; 生理的環境適応; 北部九州; 本州日本

This study revealed the followings :(i) The Ryukyu islanders were genetically closer to Honshu Japanese than Taiwan aborigine, and(ii) showed a strong relation with Hokkaido Ainu.(iii) Shovel shape of upper incisors, a common characteristic in East Asians, showed an association with a variant in EDAR gene.(iv) The mtDNA tree of the Japanese medaka showed the northern Kyushu origin that might be related to the expansion of wet rice cultivation.(v) The pattern of SNP frequencies of the genes related to alcohol metabolism was consistent with the dual structure model.

本研究发现：（一）琉球岛民在遗传上较台湾原住民更接近本州岛日本人;（二）琉球岛民与北海道阿伊努人有较强的亲缘关系。(iii)铲形上切牙是东亚人的一个常见特征，与EDAR基因的变异有关。(iv)日本青鳉的mtDNA树显示其起源于北方九州，可能与水稻栽培的扩大有关。(v)酒精代谢相关基因的SNP频率分布符合二元结构模型。

项目成果

A Common Variation in EDAR Is a Genetic Determinant of Shovel-Shaped Incisors

• DOI: 10.1016/j.ajhg.2009.09.006
• 发表时间: 2009-10-09
• 期刊: AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 9.8
• 作者: Kimura, Ryosuke;Yamaguchi, Tetsutaro;Oota, Hiroki
• 通讯作者: Oota, Hiroki

ヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の構築-メダカを用いた新たなアプローチ

人类基因多态性生物学功能分析实验体系的构建——利用青鳉的新方法

• 发表时间: 2010
• 作者: 勝村啓史;尾田正二;三谷啓志;河村正二;太田博樹
• 通讯作者: 太田博樹

メダカ集団を用いたヒト多型の生体機能解析実験系の検討-cytochrome P450に着目して

使用青鳉种群对人类多态性生物功能分析实验系统进行检查 - 重点关注细胞色素 P450

• 发表时间: 2011
• 作者: 勝村啓史;尾田正二;三谷宏志;河村正二;太田博樹
• 通讯作者: 太田博樹

日本人とヨーロッパ人におけるクローン病原因候補遺伝子の違い

日本人和欧洲人之间克罗恩病候选基因的差异

• 发表时间: 2009
• 作者: 中込滋樹;竹山康章;間野修平;向坂彰太郎;松井敏幸;河村正二;太田博樹
• 通讯作者: 太田博樹

Effects of Human Migration on Genome Diversity in East Asia

人类迁徙对东亚基因组多样性的影响

• 发表时间: 2011
• 作者: H. Oota;M. Stoneking
• 通讯作者: M. Stoneking