Elucidation of mobile loop functions in food-related enzymes

阐明食品相关酶的移动环功能

• 批准号: 21380064
• 负责人: MIKAMI Bunzo
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21380064/
• 关键词: タンパク質工学; 応用構造生物学; X線結晶構造解析; 酵素反応機構; 酵素; タンパク質構造変化; フレキシブルループ; 酵素反応; 構造生物学

The functions of proteins are usually expressed by conformational changes in loop regions. We have investigated the mobile loops in food-related enzymes that are used in food industry. The mobile loops in the active sites of.-amylase and alginate lyase that are important for incorporation of substrate and release of product are analyzed by X-ray crystal analyses of their mutant enzymes. In order to reveal the enzyme mechanism of protein-glutaminase, a mutant of pro protein-glutaminase(A47Q) was prepared. It was found that the mutated Gln47 formed Michaelis complex and S-acyl covalent intermediate with a catalytic cysteine residue.

蛋白质的功能通常由环区域的构象变化表示。我们已经调查了食品行业中使用的食品相关酶的移动循环。通过其突变酶的X射线晶体分析，分析了淀粉酶和藻酸盐裂解酶的活性位点中的移动环。为了揭示蛋白质 - 谷氨酰胺酶的酶机制，制备了蛋白质 - 谷氨酰胺酶（A47Q）的突变体。发现突变的GLN47与催化半胱氨酸残基形成了Michaelis复合物和S-acyl共价中间。

项目成果

X-ray structures of transferrins and related proteins

• DOI: 10.1016/j.bbagen.2011.08.003
• 发表时间: 2012-03-01
• 期刊: BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS
• 影响因子: 3
• 作者: Mizutani, Kimihiko;Toyoda, Mayuko;Mikami, Bunzo
• 通讯作者: Mikami, Bunzo

結晶構造に基づくプロテイングルタミナーゼの酵素機能解析

基于晶体结构的蛋白谷氨酰胺酶的酶功能分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 牧由起子;他7名
• 通讯作者: 他7名

Crystal Structures of Protein Glutaminase and Its Pro Forms Converted into Enzyme-Substrate Complex

• DOI: 10.1074/jbc.m111.255133
• 发表时间: 2011-11-04
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Hashizume, Ryota;Maki, Yukiko;Mikami, Bunzo
• 通讯作者: Mikami, Bunzo

結晶構造に基づくβ-アミラーゼの活性部位ループの機能解析

基于晶体结构的β-淀粉酶活性位点环功能分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 三上文三;他3名
• 通讯作者: 他3名

結晶構造に基づいたアミラーゼの触媒機能の解明

基于晶体结构阐明淀粉酶的催化功能

• 发表时间: 2010
• 作者: Nishiyama;M.;三上文三
• 通讯作者: 三上文三