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Structural insight into the regulation of genes controlling the legume nodule for improving agricultural traits in crops

控制豆科植物根瘤基因调控以改善作物农业性状的结构洞察

基本信息

批准号：
22K14824
负责人：
野崎翔平
金额：
$ 3万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

根粒菌と共生窒素固定を行うマメ科植物は、窒素栄養が豊富な土壌にて根粒共生を自ら抑える機構をもつが故に、農業上において望ましい “根粒共生と窒素肥料による窒素栄養の獲得の両立” が困難となっている。本研究では、栄養豊富な土壌環境下でも根粒共生できるマメ科植物の開発を見据え、鍵転写因子群が司る根粒形成遺伝子スイッチング機構を物理化学的な側面から解明することに取り組む。本研究での成果は、植物-微生物共生の研究分野に新規軸を打ち出すとともに、ダイズなどの農業上重要なマメ科植物の中で眠る潜在能力を最大限に引き出すための基盤知見にもなると期待される。初年度となる2022年度においては、根粒形成を促進する転写因子NINとそのホモログであり硝酸に応答するのみならず根粒形成を抑制する転写因子NLPの間においてDNA結合特異性および遺伝子制御の違いを生み出すアミノ酸配列モチーフを同定した。さらに、それら転写因子群のDNA結合特異性および遺伝子制御特異性を逆転させるキメラ転写因子群の作出にも成功した。またAlphaFold2による予測構造より、そのアミノ酸配列モチーフがどのような物理化学的なメカニズムでNINとNLPの異なるDNA結合特異性を生み出すのかを考察し、実際に生化学的解析でその妥当性を示した。さらには、上記の過程でデザインしたキメラ転写因子を用いることで、窒素栄養が豊富な条件下でも根粒を形成できるミヤコグサ（マメ科植物のモデル生物）の創出にも着手し始めている。さらに、構造解析に適したコンストラクトを作成し、その精製法を確立したことで、当該転写因子群と標的DNAの複合体構造を実験的に明らかにするための基盤を構築した。

Root and grain symbiosis and nutrient fixation are difficult for plants of different families to grow and cultivate in rich soil and soil. Root and grain symbiosis and self-restraint mechanism are difficult to establish in agriculture. In this study, the development of root-grain symbiosis in the environment of rich soil and rich soil was studied. The mechanism of root-grain symbiosis in the environment of rich soil and rich soil was studied. The results of this study are expected to maximize the potential of agronomically important plants in the study of plant-microorganism symbiosis. In 2022, NLP was selected as a factor for promoting the formation of root grains. NLP was selected as a factor for inhibiting the formation of root grains. The DNA binding specificity and gene control specificity of the gene expression factor group were successfully determined. The predicted structure of AlphaFold2 was investigated and the validity of its physicochemical properties was demonstrated by analyzing the DNA binding specificity of NIN and NLP. In the process described above, the formation of root grains under the condition of abundant nutrients is initiated. In addition, the structure analysis of the target DNA complex structure, the preparation of the target DNA, the purification of the target DNA complex structure, and the construction of the base plate.