Design and implementation of a novel mapping technique for single-nucleotide polymorphism genotypes using Textile Plot
Design and implementation of a novel mapping technique for single-nucleotide polymorphism genotypes using Textile Plot
使用 Textile Plot 设计和实现单核苷酸多态性基因型的新型作图技术
批准号：
21790342
负责人：
KUMASAKA Natsuhiko
金额：
$2.66万
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2009
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2009 至 2010
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英文摘要
Textile Plot is a novel visualization technique and multivariate data analysis tool in statistics. We applied it to single-nucleotide polymorphism genotype data to develop a novel mapping technique of linkage disequilibrium, selection footprints and disease genes. We provided a population genetic perspective of the plot along with a software environment implemented in JAVA language. We also performed disease gene mappings in an association study of chronic hepatitis B and a comparative study of Crohn's disease and ulcerative colitis in Japanese.
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LD mapping of disease gene and haplotype analysis on textile plot
纺织图上疾病基因的 LD 作图和单倍型分析
纺织图上疾病基因的 LD 作图和单倍型分析
DOI：
--
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
--
作者：
[Kumasaka, N., Kamatani, N.]
通讯作者：
N.
HLA-Cw*1202-B*5201-DRB1*1502 haplotype confers distinct effects on ulcerative colitis and Crohn's disease in Japanese.
HLA-Cw*1202-B*5201-DRB1*1502 单倍型对日本人的溃疡性结肠炎和克罗恩病具有独特的作用。
HLA-Cw*1202-B*5201-DRB1*1502 单倍型对日本人的溃疡性结肠炎和克罗恩病具有独特的作用。
DOI：
--
发表时间：
2011
期刊：
Gastroenterology(peer review, accepted : June 6, 2011) doi:10.1053/gastro.(in press.)
影响因子：
--
作者：
[Okada, Y., Yamazaki, K., Umeno, J., Takahashi, A., Kumasaka, N., Ashikawa, K., Aoi, T., Takazoe, M., Matsui, T., Hirano, A., Matsumoto, T., Kamatani, N., Nakamura, Y., Yamamoto, K.Kubo, M.]
通讯作者：
M.
DOI：
10.1371/journal.pone.0010207
发表时间：
2010-04-27
期刊：
PloS one
影响因子：
3.7
作者：
[Kumasaka N, Nakamura Y, Kamatani N]
通讯作者：
Kamatani N
ホームページ等。
主页等
主页等
DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
海外基金