New Oxidases Acting on Methyl-branched Polymers (Polyisoprene)

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Xanthomonas sp. Y35 wächst gut auf Poly(-cis-1,4-isopren)-haltigen Medien, kann jedoch niedelmolekulare Isoprenderivate wie Citronellol nicht verwerten. Hingegen metabolisiert Pseudomonas aeruginosa Citronellol sehr gut, kann aber Polyisopren nicht zum Wachstum nutzen. Ziel des beantragten Projektes ist es, die Spaltungsreaktion des Polyisoprenmoleküls in Xanthomonas sp. zu untersuchen und die vermuteten unterschiedlichen biochemischen Strategien des Katabolismus von Pol(-cis-1,4-isopren) und von Oligoisoprenoiden (Citronellol) sowie die jeweils daran beteiligten Proteine und Gene in einem Proteomics-Ansatz durch vergleichende 2D-Gelelektrophorese in Kombination mit einer Mutanten- und Komplementationsanalyse nachzuweisen und entsprechende Genprodukte bzw. Enzymaktivität zu identifizieren und zu charakterisieren. Als Modellorganismen für den Citronellol- und Kautschukabbau dienen Pseudomonas aeruginosa (Genom ist bereits sequenziert) und Xanthomonas sp.