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In-cell NMRによる生細胞内蛋白質の分子動態解析法の研究

In-cell NMRによる生細胞内蛋白質の分子動態解析法の研究
利用细胞内核磁共振对活细胞中蛋白质进行分子动力学分析的研究
批准号:
10J05888
负责人:
濱津 順平
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2010
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2010 至 2012

项目摘要

项目成果

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英文摘要
(1)異種核多次元NMR法をもちいた生細胞内蛋白質のダイナミクス解析本研究では,細胞内における蛋白質の詳細なダイナミクスを明らかにするため,これまでにTTHA、1718とGB1について,in-cell NMRにより大腸菌細胞内における^<15>N-T_1,T_2緩和測定を行い,精製した試料と比べともにT_1緩和時間が伸長し,T_2緩和時間が短縮されていることを示した.本年度ではこれらの緩和時間の変化の原因を検証するため,大腸菌細胞を用いたin-cell NMRにより^<15>N-DEST実験を行った.^<15>N-DEST実験では,観測対象が1MDaを超える分子量を持つ物体(細胞膜,巨大な蛋白質複合体など)と,ms-sタイムスケールで相互作用している場合,交換速度などのパラメータを解析することができる.In-cell NMRによりDEST測定を行った結果,精製した試料から得られたデータと比べ,よりブロードなプロファイルを示し,細胞内においては,細胞膜や蛋白質複合体などの巨大な分子と相互作用していることが示唆された.(2)真核細胞蛋白質大量発現系をもちいたin-cell NMR測定法の確立本研究では,精製が困難,あるいは安定性の低い蛋白質に対しても適用可能な真核細胞を用いたin-cell NMR測定法を開発するため,sf9細胞を利用したin-cell NMR測定法の確立に取り組んでおり,これまでに試料調製法の最適化により,バックグラウンドの低減に成功している.本年度では,さらに目的蛋白質の遺伝子をコードしていないウイルスを調製し,このウイルスを接種した細胞から得られたin-cell NMRスペクトルと,目的蛋白質を発現した細胞から得られたin-cell NMRスペクトルとで差スペクトルを取ることで,バックグラウンドのみを効果的に取り除くことに成功した.加えて,3D3重共鳴NMR測定にも成功し,これらのスペクトルを解析することでGB1ドメインについて主鎖シグナルの約8割の帰属に成功した.また,3D^<15>N-NOESY測定では,NOE由来のクロスピークを観測することに成功したことから,今後さらに側鎖の帰属を行うことで,真核細胞内における蛋白質の詳細な立体構造解析を行えることが考えられる.
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会议论文
メチル基選択的プロトン標識を用いたHeLa細胞中のin-cell NMR 解析
使用甲基选择性质子标记对 HeLa 细胞进行细胞内 NMR 分析
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [睛被貴洋,檳津順平, Dambarudhar Shiba Sanker Hembram,池谷鉄兵, 三島正規,白川昌宏,伊藤隆]
通讯作者: 三島正規,白川昌宏,伊藤隆
In-cell NMRによる細胞構造生物学
通过细胞内 NMR 进行细胞结构生物学
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [Jumpei Hamatsu, Daniel Nietlispach, Masaki Mishima, Teppei Ikeya, Masahiro Shirakawa, Yutaka Ito, 浜津順平]
通讯作者: 浜津順平
^<15>N NMR relaxation studies of TTHA1718 protein in living E.coli cells by in-cell NMR spectroscopy
^ 15 N NMR通过细胞内NMR光谱对活大肠杆菌细胞中的TTHA1718蛋白进行弛豫研究
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [濱津順平, 花島知美, 池谷鉄兵, 三島正規, Daniel Nietlispach, 白川昌宏, 伊藤隆]
通讯作者: 伊藤隆
Structure and dynamics of proteins at work inside cells
细胞内工作蛋白质的结构和动力学
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [伊藤隆]
通讯作者: 伊藤隆
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