课题基金 / 基金详情

In-Cell NMRを用いた生細胞内蛋白質の物性・動態解析法の開発

In-Cell NMRを用いた生細胞内蛋白質の物性・動態解析法の開発
开发一种使用细胞内核磁共振分析活细胞中蛋白质的物理性质和动力学的方法
批准号：
20050024
负责人：
伊藤 隆
金额：
$2.05万
依托单位：
Tokyo Metropolitan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20050024/
关键词：
in-cell NMR蛋白質高次構造ダイナミクス大腸菌NMR緩和速度解析細胞内環境

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生きた細胞における蛋白質分子の物性や動態を調べるために,原核生物(バクテリア)を試料としたin-cell NMR法を用いる,新しい解析手法の開発と応用に関する研究を行うことを目的とする,In-cell NMRには,生細胞内の生体高分子の高次構造や,比較的遅いタイムスケールの分子動態をアミノ酸～原子分解能で解析できるほぼ唯一の手法としての潜在的な有用性がある.一方で様々な生体高分子に普遍的に使用できるツールとなるためには手法として未成熟な点が多く,方法論的研究が希求されている.H21年度は,昨年に引き続き,大腸菌のin-cell NMRを用いて,生きた大腸菌の中の蛋白質の立体構造解析を行った.試料としては連鎖球菌のプロテインGB1ドメインを用いた.これまでの解析から,生細胞試料から得たNOE情報を用いることで,グローバル・フォールドを決定することに成功した.現在進めている構造の精密化が完了すれば,2009年に報告した高度好熱菌TTHA1718に続く,世界で2番目の高次構造決定例となる.また,生きた大腸菌の中の蛋白質の動的性質の解析も継続して行った,具体的には,in-cell NMRを用いて,大腸菌の中の高度好熱菌TTHA1718蛋白質の主鎖^<15>N核のT_1およびT_2緩和時間の測定を行い,蛋白質主鎖のダイナミクスの解析を行った.解析の結果,細胞内の粘度(水溶液の約3倍)に対応する回転相関時間の増大が観測されたが,これに加えて,何らかの原因による^<15>N核のT^2緩和時間の著しい短縮が観測された.
期刊论文(10)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Investigating protein three-dimensional structures inside living cells by in-cell NMR spectroscopy
通过细胞内核磁共振波谱研究活细胞内蛋白质的三维结构
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [S. Morita, Y. Deharu, E. Takata, M. Nakano, T. Handa, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆]
通讯作者： 伊藤隆
Solution structure of the E.coli ribosome hihernation promoting factor HPF : Implications for the relationship hetween structure and function.
大肠杆菌核糖体冬眠促进因子 HPF 的溶液结构：对结构和功能之间关系的影响。
DOI： --
发表时间： 2009
期刊： Biochemical and Biophysical Research Communications 389
影响因子： --
作者： [Akiko Sato, (他7名)]
通讯作者： (他7名)
Understanding the roles of amino acid residues in tertiary structure formation of chignolin by using molecular dynamics simulation
利用分子动力学模拟了解氨基酸残基在chignolin三级结构形成中的作用
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： PROTEINS:Structure, Function, and Bioinformatics
影响因子： --
作者： [KURODA, M, HASHIGUCHI, H, NAKAGAWA, N., 中川重和(執筆分担), Tohru Terada]
通讯作者： Tohru Terada
In-cell NMRによる細胞内蛋白質の立体構造解析
通过细胞内核磁共振对细胞内蛋白质进行三维结构分析
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [S. Morita, Y. Deharu, E. Takata, M. Nakano, T. Handa, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆, 中野実, 伊藤隆]
通讯作者： 伊藤隆
共 9 条
    金属の溶解析出反応を制御する有機物添加剤の超高感度ラマン分光学解析
    • 批准号：
      23K23441
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $2.66万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      伊藤 隆
    • 依托单位：
      Tohoku University
    In situ SERS spectroscopy for organic additives with controlling metal deposition
    • 批准号：
      22H02173
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.32万
    • 财政年份：
      2022
    • 负责人：
      伊藤 隆
    • 依托单位：
      Tohoku University
    In-situ structural biology by NMR spectroscopy
    • 批准号：
      21H02419
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.23万
    • 财政年份：
      2021
    • 负责人：
      伊藤 隆
    • 依托单位：
      Tokyo Metropolitan University
    解析困難な蛋白質の高精度立体構造決定法の開発
    • 批准号：
      22510237
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.33万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      伊藤 隆
    • 依托单位：
      Tokyo Metropolitan University
    海外基金