極域湖沼の微生物DNAに基づく大規模地球環境変動の影響評価

基于极地湖泊微生物 DNA 评估大规模全球环境变化的影响

基本信息

批准号：
10J07702
负责人：
中井亮佑
金额：
$ 0.45万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J07702/
关键词：
北極南極微生物系統多様性環境変動

项目摘要

本研究では、極域微生物の系統と多様性を評価し、近年の大規模地球環境変動に鋭敏に応答する真正細菌や真核微生物の情報をインベントリー(生物種目録の作成)することを目的とした。具体的には次のような二つの課題を実施した。1)南極湖沼底に生息する微生物系統群の特定:湖沼試料から微生物のゲノムDNAを抽出し、rRNA遺伝子(微生物分類の汎用遺伝子)や機能遺伝子をPCR法によって増幅した。得られたPCR産物を精製した後、そのPCRクローン・ライブラリーを構築した。構築したクローン・ライブラリーから目的の遺伝子断片が導入されたクローンを無作為に選び、その遺伝子の塩基配列の全長を決定した。その結果、南極湖沼底に生息する294種のクローンを特定し、Cyanobacteria(9種),Alphaproteobacteria(59種),Betaproteobacteria(16種),Gammaproteobacteria(5種),Deltaproteobacteria(30種),unclassified Proteobacteria(1種),Bacteroldetes(23種),Nitrospirae(2種),Firmicutes(12種),Chloroflexi(41種),Actinobacteria(12種),Planctomycetes(36種),Acidobacteria(19種),Verrucomicrobia(10種),candidate divisions(6種),unclassified bacteria(13種)に分類した。2)極域微生物の分離と培養:極域で採取された土壌、砂、岩石などから好塩性微生物(好塩菌)や0.2μm通過微生物(極小微生物)の分離と培養を行い、数十株を取得した。以上の成果の一部は、雑誌論文1件、国際学会におけるポスター発表3件、図書1件で公表された。

这项研究旨在评估极性微生物的系统和多样性，并库存（创建生物种类）有关近年全球大规模全球环境变化的响应性响应性的真菌和真核微生物。具体而言，实施了以下两个问题：1）鉴定生活在南极湖底底部的微生物系统发育基团：从湖泊样品中提取微生物基因组DNA，然后通过PCR扩增rRNA基因（微生物分类的一般基因）和功能基因。纯化产生的PCR产物后，构建了PCR克隆库。从构造的克隆文库中随机选择了引入靶基因片段的克隆，并确定基因的核苷酸序列的全长。结果，我们确定了生活在南极湖底，蓝细菌（9种），α-帕特罗杆菌（59种），Betaproteobacteria（16种），γ帕特罗氏菌（Gammaproteobacteria（59种），5种），deltaproteototototabacteria（30种），未分类的Proteobacteria（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）（1个物种）硝基螺旋体（2种），坚硬（12种），叶绿素（41种），肌动杆菌（12种），planctomycetes（36种），酸性杆菌（19种），肉斑肉芽病（10种），十种种类（10种），候选师（6种），未分类为Bacteria（13类型）。 2）极性微生物的隔离和培养：卤素微生物（卤素细菌）和0.2μm通过的微生物（超大型微生物）从土壤，沙子，岩石等中分离出来，并在极性区域和数十种菌株中耕种。以上一些结果发表在一篇期刊文章中，在国际学术会议上的三个海报演讲和一本书。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

微生物の生態学

微生物生态学

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
日本生態学会(編)、大園享司、鏡味麻衣子(担当編集)、中井亮佑、長沼毅;他(著)
通讯作者：
他(著)

Nitrogen fixers of an Antarctic moss pillar inferred from cyano- and proteobacterial nitrogenase genes

从蓝藻和变形菌固氮酶基因推断南极苔藓柱的固氮剂

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ryosuke Nakai;Takashi Abe;Tomoya Baba;Satoshi Imura;Hiroshi Kagoshima;Hiroshi Kanda;Yuji Kohara;Takeshi Naganuma;Hironori Niki;Katsuhiko Yanagihara
通讯作者：
Katsuhiko Yanagihara

Unique phylotypes of ultramicrobacteria isolated from Arctic terrains

从北极地区分离的超微细菌的独特系统型

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ryosuke Nakai;Eri Shibuya;Takeshi Naganuma
通讯作者：
Takeshi Naganuma

Denitrifiers of an Antarctic moss pillar inferred from nitrite reductase gene

从亚硝酸还原酶基因推断南极苔藓柱的反硝化菌

DOI：
发表时间：
2010
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ryosuke Nakai;Takeshi Naganuma;Hiroshi Kagoshima;Hironori Niki;Yuji Kohara;Satoshi Imura;Hiroshi Kanda;Katsuhiko Yanagihara;Tomoya Baba;Takashi Abe
通讯作者：
Takashi Abe

極小微生物(nanobes)の分離培養と系統分類に関する研究

微生物（纳米）分离培养及系统发育分类研究