独自のポアデバイスを用いて超微小細菌の実体と動態を捉える

使用独特的孔隙装置捕获超微细菌的物质和动态

• 批准号: 21K19394
• 负责人: 中井 亮佑
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-07-09 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19394/
• 关键词: 微生物; 細菌; デバイス; 検出; 定量

2022年度は、昨年度に引き続き、ポアデバイス試験に供する超微小細菌株の増殖特性、細胞サイズ等を特徴付けた。本研究では、生存様式の異なる3タイプの超微小細菌の検出に挑戦する計画である：タイプA：培地・培養条件に依らず細胞が常に小さい細菌、タイプB：培養条件に応じて細胞が矮小化する細菌、タイプC：形態変化を伴う多型性の細菌（微小細胞を含みうる）。昨年度、タイプAおよびBに属する菌株（Aurantimicrobium属菌等）の基盤的データを収集したため、本年度はタイプCに関するデータの取得を試みた。具体的には、コロニー形成単位計数や蛍光顕微鏡観察・電子顕微鏡観察を用いて、Oligoflexus属細菌やSilvanigrella属近縁株の形態変化とその大まかな細胞サイズを調べた。その結果として、微小な細胞が出現することに加えて、LIVE/DEAD assay kitによる細胞生存率の評価によってそれら細胞が生細胞である可能性が高いことを確認した。また一部の超微小細菌株については、粒子トラッキング法とコールター原理法による測定も実施し、電子顕微鏡による観察等で算出した細胞体積と整合的な結果が得られた。以上のように、本年度もポアデバイス検出に供する菌株の試料調製に必要なデータを収集する等の成果を得た。一方で、新型コロナウイルス感染症に伴う対応により、ポアデバイスによる実測試験の実施が困難となり、研究期間を延長するに至ったが、分担者らとともに、今後優先して測定する菌株、また実験の条件（ポア径等）に関する議論をオンライン会議等で重ねて、次年度の実測で使用するデバイスと関連する試薬・消耗品類を絞り込んだ。

In 2022, the growth characteristics of ultra-small bacteria strains and cell culture characteristics were studied. In this study, the identification and selection of ultra-small bacteria with different survival patterns were as follows: A: culture conditions, cell growth, bacteria with small size, B: culture conditions, cell growth, bacteria with small size, C: morphological variation, bacteria with polymorphism (including microcells). A. and B. strains of the genus Aurantibacterium, etc., were collected in the past year and obtained in the present year. Specific cell counts, optical microscopy, electronic microscopy, Oligoflexus, Silvanigrella, and morphological changes in large cell populations The results of the LIVE/DEAD assay kit indicate that there is a high probability that cells will be produced. Some of the ultra-small bacterial strains were detected by particle counting, electron microscopy, and integration. The above results were obtained in this year's test sample preparation and test sample collection. One way, new type of infection, associated with the disease, the difficulty of implementation of the test, the extension of the study period, the sharing of the disease, the future priority of the test strain, the condition of the disease (diameter, etc.), the discussion of the disease, the meeting, etc. The next year's test results show that the use of test products is related to the consumption category.

项目成果

培養アプローチで迫る未知・未培養微生物たちの実体

通过培养方法了解未知和未培养微生物的现实

• 发表时间: 2021
• 作者: 中井亮佑;草田裕之;玉木秀幸
• 通讯作者: 玉木秀幸

今こそ注目！すごい微生物たちの世界

现在请注意！

• 发表时间: 2021
• 作者: Okazaki Takuya;Seto Ryuichi;Watanabe Tomoaki;Ueda Akira;Kuramitz Hideki;中井亮佑
• 通讯作者: 中井亮佑

Characterization of Terrihabitans soli gen. nov., sp. nov., a Novel 0.2 μm-Filterable Soil Bacterium Belonging to a Widely Distributed Lineage of Hyphomicrobiales (Rhizobiales)

Terrihabitans soli gen., sp. 的表征，一种属于广泛分布的丝菌目（根瘤菌目）的新型 0.2 μm 可过滤土壤细菌

• DOI: 10.3390/d13090422
• 发表时间: 2021
• 期刊: Diversity
• 作者: Nakai Ryosuke;Naganuma Takeshi;Tazato Nozomi;Kunihiro Tadao;Morohoshi Sho;Koide Tomomi;Kusada Hiroyuki;Tamaki Hideyuki;Narihiro Takashi
• 通讯作者: Narihiro Takashi

精密ろ過膜を通り抜ける極小微生物の分離・解析技術 -極小微生物から新機能や付加価値・有用酵素を発掘！-

通过微滤膜的微生物的分离和分析技术 - 发现微生物的新功能、附加值和有用的酶！

• 发表时间: 2022
• 作者: 中井亮佑;山本京祐;成廣隆
• 通讯作者: 成廣隆