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極域生態系における新奇ナノ微生物相の多様性と変遷

极地生态系统中新型纳米微生物群的多样性和进化

基本信息

批准号：
13J03441
负责人：
中井亮佑
金额：
$ 6.91万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2013
资助国家：
日本
起止时间：
2013-04-01 至 2016-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13J03441/
关键词：
微生物系統分類多様性北極南極系統生物地理

项目摘要

採用3年度目である最終年度は、これまでに分離したナノ微生物菌株の生理・生化学的性状や分子系統学的位置などの情報を整理した。その結果として、自然界に生息するナノ微生物を3タイプに分類した。タイプ1は、生活史のある一時期で細胞が矮小化する。これには昨年度に報告したプロテオバクテリア門の新綱微生物Oligoflexus tunisiensis などが含まれる (Nakai et al., Int J Syst Evol Microbiol, 2014)。タイプ2は、タイプ1とは対照的に、終生を極小サイズのままで過ごす微生物である。本年度、このタイプを代表するアクチノバクテリア門の新属微生物Aurantimicrobium minutum の発見を研究論文として公表した (Nakai et al., Int J Syst Evol Microbiol, 2015)。16S rRNA 遺伝子の配列にもとづく系統解析によると、A. minutum は世界各地の淡水環境に広く分布するLuna2 とよばれる系統に帰属した。最後にタイプ3として、環境ストレスなどによって細胞が矮小化する微生物が見いだされた。この微生物は北極域の温泉だけでなく、中国のゴビ砂漠や日本国内の土壌からも同じ遺伝型のものが分離された。さらに、その系統分類の結果、プロテオバクテリア門の新しい科を代表する系統であることが判明したため、論文公表の準備を進めた。また、当初の予定より遅れていた極域試料中の微生物相解析については、昨年度アラスカ北極圏や南極大陸で採取した試料を用いることで、16S rRNA 遺伝子の網羅的な塩基配列解読を複数実施することができた。

採用3年度目である最終年度は、これまでに分離したナノ微生物菌株の生理·生化学的性状や分子系統学的位置などの情報を整理した。その結果として、自然界に生息するナノ微生物を3タイプに分類した。タイプ1は、生活史のある一時期で細胞が矮小化する。突尼斯寡柔菌属Oligoflexus tunisiensis（Nakai et al.，Int J Syst Evol Microbiol，2014）。タイプ2は、タイプ1とは対照的に、終生を極小サイズのままで過ごす微生物である。本年度，黄曲霉毒素代表着一种新的属微生物Aurantimicrobium minutum微生物学研究，Int J Syst Evol Microbiol，2015）。16S rRNA核糖核酸配位序列分析表明，A. minutum月球世界各地的淡水河谷环境过渡带分布在月球2号上，月球2号是一个由海洋生物组成的系统。最後にタイプ3として、環境ストレスなどによって細胞が矮小化する微生物が見いだされた。この微生物は北極域の温泉だけでなく、中国のゴビ砂漠や日本国内の土壌からも同じ遺伝型のものが分離された。さらに、その系統分類の結果、プロテオバクテリア門の新しい科を代表する系統であることが判明したため、論文公表の準備を進めた。目前，我国已确定了16 S rRNA基因组DNA的序列测定方法，其中包括对16 S rRNA基因组DNA的序列测定方法、对16S rRNA基因组DNA的序列测定方法、对16S rRNA基因组DNA的序列测定方法、对16S rRNA基因组DNA的序列测定方法等。