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Ligand binding sites on the surface of protein quaternary structures
蛋白质四级结构表面的配体结合位点
基本信息
- 批准号：21700321
- 负责人：
- 金额：$ 1.16万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份：2009
- 资助国家：日本
- 起止时间：2009 至 2010
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
Protein-ligand interaction is a basic process underlying diverse biological phenomena. The ultimate goal of this project is to reveal how the location of ligand binding sites on protein surface have been selected in the course of evolution. We have developed a dataset of protein quaternary structures with ligands. We then have taken the statistics of the location of ligand binding sites, and have analyzed the relationships between the location and geometric feature of the ligand binding site, protein dynamics and protein function, respectively.
蛋白质-配体相互作用是多种生物现象的基本过程。该项目的最终目的是揭示在进化过程中，配体结合位点在蛋白质表面的位置是如何被选择的。我们已经开发了一个配体的蛋白质四级结构数据集。然后我们对配体结合位点的位置进行了统计，并分别分析了配体结合位点的位置和几何特征与蛋白质动力学和蛋白质功能之间的关系。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Development of protein-ligand complex's database considering biological units.
考虑生物单位的蛋白质-配体复合物数据库的开发。
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：M.Morita;T.Terada;S.Nakamura;K.Shimizu.;Mizuki Morita;森田瑞樹;森田瑞樹;H.Ikezawa.
- 通讯作者：H.Ikezawa.
Development of protein-ligand complex's database considering biologicalunits
考虑生物单位的蛋白质-配体复合物数据库的开发
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：M.Morita;T.Terada;S.Nakamura;K.Shimizu.;Mizuki Morita;森田瑞樹;森田瑞樹;H.Ikezawa.;池澤弘貴
- 通讯作者：池澤弘貴
タンパク質の機能とダイナミクスと四次構造
蛋白质功能、动力学和四级结构
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：M.Morita;T.Terada;S.Nakamura;K.Shimizu.;Mizuki Morita;森田瑞樹;森田瑞樹
- 通讯作者：森田瑞樹
BUDDY-system: A web site for constructing a dataset of protein pairs between ligand-bound and unbound states.
- DOI：10.1186/1756-0500-4-143
- 发表时间：2011-05-22
- 期刊：
- 影响因子：1.8
- 作者：Morita M;Terada T;Nakamura S;Shimizu K
- 通讯作者：Shimizu K
タンパク質のリガンド結合部位と四次構造
配体结合位点和蛋白质的四级结构
- DOI：
- 发表时间：2011
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：M.Morita;T.Terada;S.Nakamura;K.Shimizu.;Mizuki Morita;森田瑞樹
- 通讯作者：森田瑞樹
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