Analysis of distribution history of forest trees based on DNA sequences from pollen grains in sediment samples

基于沉积物样本花粉粒DNA序列分析林木分布历史

• 批准号: 22658046
• 负责人: SUYAMA Yoshihisa
• 金额: $ 2.28万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22658046/
• 关键词: 古代 DNA; 分子系統地理; 花粉分析; 針葉樹; 湖底堆積物; 山岳氷河; 古代DNA; 葉緑体DNA; ミトコンドリアDNA; スウェーデン; 国際研究者交流

We developed a method for DNA analysis of ancient pollen from lake sediments and glaciers to retrieve genetic information for past spatial dynamics of intra- and/or inter-specific lineage. We reported genetic analysis of fossil pollen collected from lake sediment in central Norway and showed that conifer trees survived in ice-free refugia of Scandinavia during the last glaciation. And we compared DNA- and pollen-based vegetation analysis of the lake sediment samples. We also reported DNA analysis of Pinus pollen grains collected from Belukha glacier in Russia and identified them at the section level in the genus. These results have major implications for plant phylogeography by allowing direct analysis of past genetic information in ancient pollen.

我们开发了一种方法，从湖泊沉积物和冰川的古花粉的DNA分析，检索遗传信息，过去的空间动态内和/或种间谱系。我们报告了从挪威中部湖泊沉积物中收集的化石花粉的遗传分析，结果表明，在末次冰期，针叶树在斯堪的纳维亚半岛的无冰避难所生存。我们比较了湖泊沉积物样本的DNA和花粉植被分析。我们还报道了从俄罗斯贝卢哈冰川采集的松属花粉的DNA分析，并在组水平上鉴定了它们。这些结果有重大意义的植物群落地理学允许直接分析过去的遗传信息在古代花粉。

项目成果

氷河試料中のマツ属花粉1粒ずつDNA分析(2)

对冰川样本中每个松属花粉粒的 DNA 分析 (2)

• 发表时间: 2010
• 作者: Yoshihisa Suyama;他 5 名;Fumio Nakazawa;中澤文男;中澤文男;中澤文男;(代表者)中澤文男
• 通讯作者: (代表者)中澤文男

Laura Parducci, Irina Matetovici, Sonia L. Fontana, K.D. Bennett

劳拉·帕尔杜奇 (Laura Parducci)、伊琳娜·马特托维奇 (Irina Matetovici)、索尼娅·L.丰塔纳 (Sonia L. Fontana)、K.D.

• 发表时间: 2013
• 期刊: Molecular and pollen-based vegetation analysis in lake sediments from central Scandinavia. Molecular Ecology
• 作者: Yoshihisa Suyama;他 5 名
• 通讯作者: 他 5 名

森の分子生態学2(第3部第8章:花粉1粒DNA分析法)

森林分子生态学2（第3部分第8章：单花粉粒DNA分析方法）

• 发表时间: 2012
• 作者: Yoshihisa Suyama;他 5 名;Fumio Nakazawa;中澤文男;中澤文男;中澤文男;(代表者)中澤文男;陶山佳久
• 通讯作者: 陶山佳久

節レベルでの同定を目的としたベルーハ氷河中のマツ属花粉1粒ずつのDNA分析

对 Beluja 冰川中单个松属花粉粒进行 DNA 分析，进行节点级识别

• 发表时间: 2011
• 作者: Yoshihisa Suyama;他 5 名;Fumio Nakazawa;中澤文男;中澤文男;中澤文男
• 通讯作者: 中澤文男

Single-pollen genotyping of Holocene lake sediments.In : Single-pollen genotyping.

全新世湖泊沉积物的单花粉基因分型。In：单花粉基因分型。

• 发表时间: 2011
• 作者: Yoshihisa Suyama;他 5 名;Fumio Nakazawa;中澤文男;中澤文男;中澤文男;(代表者)中澤文男;陶山佳久;Yoshihisa Suyama;Laura Parducci
• 通讯作者: Laura Parducci