Quantum Mechanical Studies of Proton Affinity of Amino Acid Residues in Protein Environments
蛋白质环境中氨基酸残基质子亲和力的量子力学研究
基本信息
- 批准号:22740259
- 负责人:
- 金额:$ 2.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2010
- 资助国家:日本
- 起止时间:2010-04-01 至 2014-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Protons play crucial roles in biomolecules. We studied the effects of nanoscale environment on proton affinity of amino acid residues using computer simulations based on quantum mechanics. The purpose of this study is to develop quantum mechanical analysis of structural information of proteins.In this study, we focused on the three environments:(1)the environment around isolated amino acid residues in solution, (2) the environment around amino acid residues working for proton pumping activity in cytochrome c oxidase, (3) the environment around amino acid residues working for amide-bond cleavage reaction in nylon-oligomer hydrolase. The present computer simulations based on quantum mechanics highlight the importance of physiological protein structures in terms of proton affinity.
质子在生物分子中起着至关重要的作用。我们利用基于量子力学的计算机模拟方法研究了纳米环境对氨基酸残基质子亲和力的影响。本研究的目的是开展蛋白质结构信息的量子力学分析。在这项研究中,我们重点研究了三个环境:(1)溶液中分离的氨基酸残基周围的环境,(2)细胞色素c氧化酶中氨基酸残基作用于质子泵活性的环境,(3)尼龙-低聚物水解酶中氨基酸残基作用于酰胺键断裂反应的环境。目前基于量子力学的计算机模拟强调了生理蛋白质结构在质子亲和力方面的重要性。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Energetics and Electronic Structures of Alkanes and Polyethylene Adsorbed on Graphene
- DOI:10.7567/jjap.52.06gd10
- 发表时间:2013-06-01
- 期刊:
- 影响因子:1.5
- 作者:Kamiya, Katsumasa;Okada, Susumu
- 通讯作者:Okada, Susumu
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- DOI:
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Moon Young Yang;Katsumasa Kamiya;and Kenji Shiraishi
- 通讯作者:and Kenji Shiraishi
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- DOI:10.1149/05807.0181ecst
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Katsumasa Kamiya;Moon Young Yang;Blanka Magyari-Kope;Masaaki Niwa;Yoshio Nishi;and Kenji Shiraishi
- 通讯作者:and Kenji Shiraishi
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- DOI:10.1063/1.4825071
- 发表时间:2013-10-01
- 期刊:
- 影响因子:1.6
- 作者:Yang, Moon Young;Kamiya, Katsumasa;Shiraishi, Kenji
- 通讯作者:Shiraishi, Kenji
Ab initio Modeling of Resistive Random Access Memories
电阻式随机存取存储器从头开始建模
- DOI:
- 发表时间:2013
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T. Akimoto;and T. Miyaguchi;S. Kobayashi;Katsumasa Kamiya
- 通讯作者:Katsumasa Kamiya
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