Development of high throughput screening method of G-quadruplexes using small molecules

使用小分子开发 G-四链体的高通量筛选方法

• 批准号: 23310158
• 负责人: NAGASAWA Kazuo
• 金额: $ 12.56万
• 依托单位: Tokyo University of Agriculture and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23310158/
• 关键词: グアニン四重鎖; テロメア; DNAマイクロアレイ; テロメスタチン; 蛍光プローブ; 結合タンパク質; グアニン四重鎖構造; テロメア配列; G-quadruplex; ガン化学療法

G-Quadruplexes (G4s) are three-dimensional structures that are formed in guanine-rich polynucleotides. Relatively few G4-forming oligonucleotides (GFOs) have been identified so far, but they are important because they play significant roles in regulation of gene expression and replication. Computational analysis suggests huge numbers of GFOs are present in the genome. However, there has been no simple and direct screening methodology for large-scale screening of GFOs.In this project, we have developed a high-throughput screening method for GFOs by using the fluorescent G4 ligand L1Cy5-7OTD with a DNA microarray. With this method, we found 1,998 novel GFOs in a CpG island (CGI) microarray bearing 88,737 targets. Gene Ontology (GO) analysis suggests that these GFOs were mainly associate with metabolic processes, transcriptional regulation, biosynthetic processes and developmental processes. The present method would be easily applicable to other DNA microarrays.

g -四plex （G4s）是在富含鸟嘌呤的多核苷酸中形成的三维结构。到目前为止，相对较少的g4形成寡核苷酸（GFOs）被发现，但它们在基因表达和复制的调控中起着重要作用。计算分析表明，基因组中存在大量的gfo。然而，目前还没有一种简单直接的方法来大规模筛选gfo。在本项目中，我们利用荧光G4配体L1Cy5-7OTD与DNA微阵列开发了一种高通量筛选GFOs的方法。通过这种方法，我们在CpG岛（CGI）微阵列中发现了1,998个新的gfo，其中包含88,737个靶标。基因本体（Gene Ontology， GO）分析表明，这些gfo主要与代谢过程、转录调控、生物合成过程和发育过程有关。该方法可以很容易地应用于其他DNA微阵列。

项目成果

ピロールイミダゾール系アルカロイド類の合成研究

吡咯咪唑生物碱的合成研究

• 发表时间: 2013
• 作者: 岩田真;狩野恭兵;今岡拓哉;長澤和夫
• 通讯作者: 長澤和夫

Organocatalytic α-Hydroxylation of β-Ketoesters and Application to Synthesis of Daunomycinone

β-酮酯的有机催化α-羟基化及其在道诺霉素合成中的应用

• 发表时间: 2013
• 作者: 岩田真;狩野恭兵;今岡拓哉;長澤和夫;古郡孝太 小田木陽 渡邉達也 長澤和夫
• 通讯作者: 古郡孝太 小田木陽 渡邉達也 長澤和夫

phakellin類の全合成研究

phakellins的全合成研究

• 发表时间: 2012
• 作者: 今岡拓哉;秋元隆史;狩野恭平;岩田真;岩本理;長澤和夫
• 通讯作者: 長澤和夫

Asymmetric α-Hydroxylation of Lactone with Vinylogous Pyridone using Guanidine-Urea Bifunctional Organocatalyst: Catalystic Enantioselective Synthesis of a Key Intermediate for (20S)-Camptothecin Analogues

使用胍-脲双功能有机催化剂对内酯与乙烯吡啶酮进行不对称 α-羟基化：催化对映选择性合成 (20S)-喜树碱类似物的关键中间体

• 发表时间: 2014
• 期刊: Chem. Eur. J.
• 作者: Tatsuya Watanabe;Minami Odagi;Kota Furukori and Kazuo Nagasawa
• 通讯作者: Kota Furukori and Kazuo Nagasawa

Synthesis of macrocyclic hexaoxazole (6OTD) and evaluation of its G4 stabilization

大环六恶唑(6OTD)的合成及其G4稳定性评价

• 发表时间: 2012
• 作者: 大竹輝美;飯田圭介;中村貴大;長澤和夫
• 通讯作者: 長澤和夫