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Crystal structure of human Band3 (anion exchanger)

人Band3（阴离子交换剂）的晶体结构

基本信息

批准号：
23370049
负责人：
KOBAYASHI TAKUY
金额：
$ 12.31万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011-04-01 至 2014-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Human AE1 is a 110kDa glycoprotein. It is built from two domains, a cytosolic N-terminal domain (residues 1-360) and an integral membrane domain (residues 361-911). Anion exchange is catalysed by the C-terminal domain. However, only the crystal structure of the cytosolic N-terminal domain, important as an anchoring point for other proteins including the scaffolding protein ankyrin and deoxy-hemoglobin, has been determined. As such the details of the topology, the substrate recognition, and the anion-transport mechanism of this fundamental protein remain unclear. We analyzed the crystal structure at 3.4 angstrom resolution of the membrane domain of human AE1 locked in an outward open conformation by a covalently bound H2DIDS-inhibitor in complex with a Fab fragment from a monoclonal antibody. We also need the structure of an inward-facing open conformation or an outward-facing open conformation at higher resolution to understand the fully anion exchange mechanism of AE1.

人AE 1是一种110 kDa的糖蛋白。它由两个结构域构建，一个胞质N-末端结构域（残基1-360）和一个完整的膜结构域（残基361-911）。阴离子交换由C-末端结构域催化。然而，只有胞质N-末端结构域的晶体结构，作为其他蛋白质的锚定点，包括支架蛋白锚蛋白和脱氧血红蛋白，已被确定。因此，这种基本蛋白的拓扑结构、底物识别和阴离子转运机制的细节仍不清楚。我们分析了在3.4埃分辨率的晶体结构的膜结构域的人AE 1锁定在一个向外的开放构象的共价结合的H2 DIDS抑制剂的复合物与Fab片段从单克隆抗体。我们还需要更高分辨率的向内开放构象或向外开放构象的结构来理解AE 1的完全阴离子交换机制。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

GPCRをターゲットにした『構造に指南された創薬』を目指すための三つの戦略

针对 GPCR 的“结构引导药物发现”的三种策略

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
香月博志;小袋加奈絵;延永瑞希;森岡弘志;久恒昭哲;下川宏明;筒井正人;小林拓也
通讯作者：
小林拓也

Towards Structure Based GPCRs Pharmacology; From Knockout Mice to Crystal Structures

基于结构的 GPCR 药理学；

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kobayashi;T.
通讯作者：
T.

Molecular Basis of Antihistamine Specificity Against Human Histamine H1 Receptor(シンポジウム)

针对人组胺 H1 受体的抗组胺特异性的分子基础（研讨会）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
住田一真;内田裕美子;西山宗一郎;川岸郁朗 ;今田勝巳;小林拓也
通讯作者：
小林拓也

Structure of the human histamine H1 receptor complex with doxepin.

DOI：
10.1038/nature10236
发表时间：
2011-06-22
期刊：
NATURE
影响因子：
64.8
作者：
Shimamura, Tatsuro;Shiroishi, Mitsunori;Weyand, Simone;Tsujimoto, Hirokazu;Winter, Graeme;Katritch, Vsevolod;Abagyan, Ruben;Cherezov, Vadim;Liu, Wei;Han, Gye Won;Kobayashi, Takuya;Stevens, Raymond C.;Iwata, So
通讯作者：
Iwata, So

Towards structure based GPCR pharmacology

迈向基于结构的 GPCR 药理学