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Development of analytical method for structural change dynamics of biomolecules and its application
生物分子结构变化动力学分析方法的发展及其应用
基本信息
- 批准号：23655020
- 负责人：
- 金额：$ 2.58万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- 财政年份：2011
- 资助国家：日本
- 起止时间：2011 至 2012
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
Canine milk lysozyme (CML) is a calcium binding protein belonging to the lysozyme family. Although CML and goat α-lactalbumin (GLA) are highly homologous, it was found in recent experimental results that the unfolding pathway of CML is different from that of GLA. We examined the difference between the unfolding pathways of CML and GLA by performing all-atom molecular dynamics simulations. As a result, we found that the difference of the unfolding pathways is due to the presence of absence of local interactions in these proteins. In addition, we developed a novel method for the structure transitions based on third-order nonlinear spectroscopy.
犬乳溶菌酶（CML）是一种钙结合蛋白，属于溶菌酶家族。虽然CML与山羊α-乳清蛋白（GLA）具有高度同源性，但最近的实验结果发现CML的展开途径与GLA不同。我们通过进行全原子分子动力学模拟来检查CML和GLA展开途径之间的差异。结果，我们发现展开途径的差异是由于这些蛋白质中缺乏局部相互作用的存在。此外，我们还开发了一种基于三阶非线性光谱的结构跃迁新方法。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Dynamics of liquid water : Energy relaxation and fluctuation
液态水动力学：能量弛豫和波动
- DOI：
- 发表时间：2012
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Arend G. Dijkstra;谷村吉隆;関東詩織;T. Kaneko;Y. Tanimura;斉藤真司
- 通讯作者：斉藤真司
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- DOI：
- 发表时间：2012
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Masahito Murai;Manabu Sugimoto;and Munetaka Akita;斉藤真司
- 通讯作者：斉藤真司
Molecular origin of the difference in the HOH bend of the IR spectra between liquid water and ice
- DOI：10.1063/1.4789951
- 发表时间：2013-02-07
- 期刊：
- 影响因子：4.4
- 作者：Imoto, Sho;Xantheas, Sotiris S.;Saito, Shinji
- 通讯作者：Saito, Shinji
Insights in quantum dynamical effects in the infrared spectroscopy of liquid water from a semiclassical study with an ab initio-based flexible and polarizable force field.
- DOI：10.1063/1.3670960
- 发表时间：2011-12
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Jian Liu;W. Miller;G. Fanourgakis;S. Xantheas;S. Imoto;S. Saito
- 通讯作者：Jian Liu;W. Miller;G. Fanourgakis;S. Xantheas;S. Imoto;S. Saito
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LEE Jin Yong
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