イネのアルミニウム耐性に関与するQTL遺伝子の同定

1.選抜したアルミニウム耐性イネ品種日本晴と感受性品種7098のF2マッピング集団を用いて、アルミニウム耐性に関与するQTL解析を再度行った。形質の評価はアルミニウム存在下72時間の根の伸長阻害を指標に行った。またSNPアレイでゲェノタイピングを行った。その結果、アルミニウム耐性QTLは第1と第3染色体上に検出された。2.これらのQTLを確認するために、F3集団を用いて再確認した。その結果、染色体第1番のQTLは確認できたが、染色体3番のQTLは検出できなかった。代わりに染色体8番に新たなQTLが検出された。現在染色体1番のQTLに着目して、遺伝子の単離に向けて材料の作出を行っている。3.コシヒカリ―カサラスの交配集団を用いて、アルミニウム耐性QTLが染色体1、2と6番に検出されたが、これらQTL遺伝子の単離にはまだ至っていない。染色体2番のQTLは我々が同定したNrat1遺伝子(アルミニウムトランスポーターをコードする遺伝子)と同じ位置に座乗しているため、2番染色体のQTL遺伝子の可能性がある。それを検討するために、まずNrat1の発現量を比較した結果、根でのNart1の発現量はカサラスよりコシヒカリのほうが高かった。また根細胞内のアルミニウム濃度もコシヒカリのほうが高かった。コシヒカリ―カサラス染色体置換系統を用いて検討した結果、コシヒカリのNrat1領域がカサラスに置換されると、アルミニウム耐性が減少した。現在置換系統の種子を増やしており、充分量の種子が採れ次第、細胞内アルミニウム濃度、Nrat1の発現量などを検討する予定である。

1.選抜したアルミニウム耐性イネ品種日本晴と感受性品種7098のF2マッピング集団を用いて、アルミニウム耐性に関与するQTL解析を再度行った。形質の評価はアルミニウム存在下72時間の根の伸長阻害を指標に行った。またSNPアレイでゲェノタイピングを行った。その結果、アルミニウム耐性QTLは第1と第3染色体上に検出された。2.これらのQTLを確認するために、F3集団を用いて再確認した。その結果、染色体第1番のQTLは確認できたが、染色体3番のQTLは検出できなかった。代わりに染色体8番に新たなQTLが検出された。現在染色体1番のQTLに着目して、遺伝子の単離に向けて材料の作出を行っている。3.コシヒカリ―カサラスの交配集団を用いて、アルミニウム耐性QTLが染色体1、2と6番に検出されたが、これらQTL遺伝子の単離にはまだ至っていない。染色体2番のQTLは我々が同定したNrat1遺伝子(アルミニウムトランスポーターをコードする遺伝子)と同じ位置に座乗しているため、2番染色体のQTL遺伝子の可能性がある。それを検討するために、まずNrat1の発現量を比較した結果、根でのNart1の発現量はカサラスよりコシヒカリのほうが高かった。また根細胞内のアルミニウム濃度もコシヒカリのほうが高かった。コシヒカリ―カサラス染色体置換系統を用いて検討した結果、コシヒカリのNrat1領域がカサラスに置換されると、アルミニウム耐性が減少した。現在置換系統の種子を増やしており、充分量の種子が採れ次第、細胞内アルミニウム濃度、Nrat1の発現量などを検討する予定である。