太平洋域の放散虫類の分子系統、遺伝的多様性、生物地理

今年度は、以下の研究を行った。<実験1>白鳳丸によって採集されたDとEの測点の個々の放散虫サンプルからDNAを抽出し、PCR法により18S rRNA、ITS、28S rRNA領域の増幅と塩基配列の決定を行った。その結果5個体から放散虫由来の塩基配列を得ることができた。<実験2>白鳳丸によって採集されたDとEの測点の海水濾過フィルターサンプルからRNAとDNAの抽出を行った。その結果RNAは抽出されなかったが、DNAについては抽出に成功した。現在ピコプランクトンの存在について抽出されたDNAを鋳型にして、PCR法を用いて確認している。ピコプランクトンの存在が確認されれば、放散虫類の生活史や生活環境とピコプランクトンとの関連を明らかにすることができるだろう。<実験3>相模湾において採水を行い、フィルター濾過により得たサンプルについてRNA抽出を試みた。いくつか条件を変えて実験を行ったが、残念ながらRNAを得ることはできなかった。<実験4>放散虫類と同じリザリア類に属す有孔虫を用いて、殻体形成に関与する遺伝子の単離を行うため、同一種で殻体を分泌している個体と殻体をまだ分泌していない個体とをそれぞれ分けてサンプリングし、それぞれRNA抽出を行った。今後さらに個体数を増やし、RNA増幅キットを用いて必要量のRNAを増幅し、トランスクリプトーム解析を行う計画である。これらの解析により、殻体を形成している時に特異的に発現する遺伝子を同定し、リザリア類における殻体形成のメカニズムに迫る計画である。

今年度は、以下の研究を行った。<実験1>白鳳丸によって採集されたDとEの測点の個々の放散虫サンプルからDNAを抽出し、PCR法により18S rRNA、ITS、28S rRNA領域の増幅と塩基配列の決定を行った。その結果5個体から放散虫由来の塩基配列を得ることができた。<実験2>白鳳丸によって採集されたDとEの測点の海水濾過フィルターサンプルからRNAとDNAの抽出を行った。その結果RNAは抽出されなかったが、DNAについては抽出に成功した。現在ピコプランクトンの存在について抽出されたDNAを鋳型にして、PCR法を用いて確認している。ピコプランクトンの存在が確認されれば、放散虫類の生活史や生活環境とピコプランクトンとの関連を明らかにすることができるだろう。<実験3>相模湾において採水を行い、フィルター濾過により得たサンプルについてRNA抽出を試みた。いくつか条件を変えて実験を行ったが、残念ながらRNAを得ることはできなかった。<実験4>放散虫類と同じリザリア類に属す有孔虫を用いて、殻体形成に関与する遺伝子の単離を行うため、同一種で殻体を分泌している個体と殻体をまだ分泌していない個体とをそれぞれ分けてサンプリングし、それぞれRNA抽出を行った。今後さらに個体数を増やし、RNA増幅キットを用いて必要量のRNAを増幅し、トランスクリプトーム解析を行う計画である。これらの解析により、殻体を形成している時に特異的に発現する遺伝子を同定し、リザリア類における殻体形成のメカニズムに迫る計画である。